Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12258
- Subject:
- NM_001352163.1
- Aligned Length:
- 1488
- Identities:
- 1025
- Gaps:
- 462
Alignment
Query 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------ATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 63
Query 445 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 137
Query 519 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 138 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 211
Query 593 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 285
Query 667 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 359
Query 741 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA 433
Query 815 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC 507
Query 889 CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT 581
Query 963 CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGTTGTACTCATC---------------- 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGTTGTACTCATCTTGTATCCTTCTGGAA 655
Query 1021 -----------------------------------------------------------------TTTTACCTA 1029
|||||||||
Sbjct 656 ACCCATCATTGCCTCTGTTCAGCAAACCTGTCTCCTGGGACTCTAGACCGAGCACTTCTTGGACTTTTTACCTA 729
Query 1030 ATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGC 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 ATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGC 803
Query 1104 CATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCC 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 CATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCC 877
Query 1178 TGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTC 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 TGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTC 951
Query 1252 CTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGA 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 CTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGA 1025
Query 1326 GCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCC 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 GCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCC 1099
Query 1400 AGCACCAG 1407
||||||||
Sbjct 1100 AGCACCAG 1107