Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12258
• Subject: XM_011245758.2
• Aligned Length: 1636
• Identities: 1268
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAGCAGCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTGTTCCACGACAGGGTCCGCGAGTGCATCAT  74

Query   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148
            .||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148

Query  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTGGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTC  222

Query  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296
            ||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct  223  GCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGAGGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTA  296

Query  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACCTCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCC  370

Query  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444

Query  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCTTGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATC  518

Query  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592
            .||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  519  CGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACTTCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCT  592

Query  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666
            ||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  ACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACTCCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCT  666

Query  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740
            ||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGAGGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGA  740

Query  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTA---------------------------------------------  769
            |||||||||.|||||.||.||.|||||.|                                             
Sbjct  741  GGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAGTGAGTCTAAATCCGCCCTTGCTTGGGTGGTGGTGGCCCGGCCTT  814

Query  770  --------------------------------------------ATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACA  799
                                                        ||||.||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct  815  GGCAAGGACTGAGTATTGGAGGGAAGTATGTCCTGTGCCCTCAGATCCCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACA  888

Query  800  TGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCT----------------------  851
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||| ||                      
Sbjct  889  TGGAACTGCTGCATAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTCCT-CTTGGGTATGTGGCCTGGTAGTTT  961

Query  852  ------GGAG----------------------------------------------------AAGAGGCGGAAG  867
                  ||||                                                    |||.|.||||||
Sbjct  962  ACCCAAGGAGAGTTGTTCCTTGTCCCAAGTACTTACTAACGACCTCCCACCCACACACAGAAAAGCGTCGGAAG  1035

Query  868  GCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT  941
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GCGTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT  1109

Query  942  GCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATG----------  1005
            .|||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||          
Sbjct 1110  CCTCATCGTGGCTGTCCACATCCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTGCCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTG  1183

Query 1006  --------------------------------------------------CAGGTTGTACTCATCTTTTACCTA  1029
                                                              ||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1184  CCCTAGGCCAGGCCTCCTTCTCCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATCATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTG  1257

Query 1030  ATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGC  1103
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||..|
Sbjct 1258  ATGGTGTCCTCAGTGGTGGGTTTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAGCCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATC  1331

Query 1104  CATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCC  1177
            .|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1332  GATGACACAGATCATTGGGAACTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTC  1405

Query 1178  TGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTC  1251
            |.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1406  TTGGCCTGACACGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTC  1479

Query 1252  CTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGA  1325
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1480  CTCTACAACGCAGCCTTTGCTGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGA  1553

Query 1326  GCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCC  1399
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.||||||||||..|
Sbjct 1554  GCTGATCCGAGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTGGGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGC  1627

Query 1400  AGCACCAG  1407
            ||||.||.
Sbjct 1628  AGCATCAA  1635