Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12258
- Subject:
- XM_017316773.1
- Aligned Length:
- 1663
- Identities:
- 1240
- Gaps:
- 287
Alignment
Query 1 ATGGAA--------GCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAA-------------CAG-CT---ATTCC 49
|||..| |||| |||| |||| ||.|| ||| || .||||
Sbjct 1 ATGACACACACCCCGCAC--GACT-----------TCCG---GATAATTTGTTTGACACTCAGACTGGGTTTCC 58
Query 50 ACGAGAGG--ATCCGCGAGTGTATTATATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCC 121
| | |||| || |||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 59 A------GCCATCC-CG-------TATCTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCC 118
Query 122 TGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTC 195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 119 TGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTG 192
Query 196 GAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGA 269
|||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 193 GAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTCGCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGA 266
Query 270 GGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACC 343
||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 267 GGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTACTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACC 340
Query 344 TTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGC 417
|.|||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 341 TCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCCTCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGC 414
Query 418 TTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCT 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 415 TTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCT 488
Query 492 GGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACT 565
.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.||||
Sbjct 489 TGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATCCGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACT 562
Query 566 TTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACT 639
|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 563 TCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCTACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACT 636
Query 640 CCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGA 713
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 637 CCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCTGTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGA 710
Query 714 GGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTA------------------ 769
|||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 711 GGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAGTGAGTCTAAATCCGCCC 784
Query 770 -----------------------------------------------------------------------ATC 772
|||
Sbjct 785 TTGCTTGGGTGGTGGTGGCCCGGCCTTGGCAAGGACTGAGTATTGGAGGGAAGTATGTCCTGTGCCCTCAGATC 858
Query 773 CTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTC 846
|.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 859 CCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACATGGAACTGCTGCATAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTC 932
Query 847 CTGCT----------------------------GGAG------------------------------------- 855
|| || ||||
Sbjct 933 CT-CTTGGGTATGTGGCCTGGTAGTTTACCCAAGGAGAGTTGTTCCTTGTCCCAAGTACTTACTAACGACCTCC 1005
Query 856 ---------------AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTG 914
|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1006 CACCCACACACAGAAAAGCGTCGGAAGGCGTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTG 1079
Query 915 CTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTG 988
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1080 CTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTCCTCATCGTGGCTGTCCACATCCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTG 1153
Query 989 CCATGCCCCGAGGCATG--------------------------------------------------------- 1005
|||||||.||.||||||
Sbjct 1154 CCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTGCCCTAGGCCAGGCCTCCTTCTCCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATC 1227
Query 1006 ---CAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAG 1076
||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|.||
Sbjct 1228 ATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTGATGGTGTCCTCAGTGGTGGGTTTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAG 1301
Query 1077 CCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCT 1150
||||.||||.||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1302 CCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATCGATGACACAGATCATTGGGAACTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCT 1375
Query 1151 CAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAAC 1224
||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTCTTGGCCTGACACGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAAC 1449
Query 1225 TGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAA 1298
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 TGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCTGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAA 1523
Query 1299 GACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCG 1372
|||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1524 GACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGAGCTGATCCGAGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTG 1597
Query 1373 GTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1407
|.||.||||.|||.||||||||||..|||||.||.
Sbjct 1598 GGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGCAGCATCAA 1632