Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12261
• Subject: XM_005253424.4
• Aligned Length: 1277
• Identities: 1093
• Gaps: 172

Alignment

Query    1  --------MDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIK  66
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MHQDQRFRMDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIK  74

Query   67  DKEEVNGIEEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLD  140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DKEEVNGIEEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLD  148

Query  141  AGDPASGVLASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEP  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGDPASGVLASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEP  222

Query  215  VPVEPISGDCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRT  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  VPVEPISGDCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRT  296

Query  289  FEPKSVPVCEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSD  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  FEPKSVPVCEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSD  370

Query  363  RPPENEKKVEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEII  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RPPENEKKVEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEII  444

Query  437  PILEKLAPSEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEV  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PILEKLAPSEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEV  518

Query  511  ISQNETCSPEVESNEKDNRPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVKI  584
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ISQNETCSPEVESNEKDNKPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVKI  592

Query  585  TAKGDINQKLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKED  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAKGDINQKLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKED  666

Query  659  LKKRHEHPPNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVVS  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LKKRHEHPPNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVVS  740

Query  733  SQPKLQTPVTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  SQPKLQTPVTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVT  814

Query  807  NQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHSI  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  NQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHSI  888

Query  881  VQATRTSLPTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQC  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  VQATRTSLPTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQC  962

Query  955  GKATGSDSSGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIHL  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GKATGSDSSGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIHL  1036

Query 1029  LPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSKRFFLYMAP  1102
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.........
Sbjct 1037  LPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTT  1110

Query 1103  RYM-----------------------------------------------------------------------  1105
            .|.                                                                       
Sbjct 1111  TYVVNNGLTLGSTGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGI  1184

Query 1106  --------------------------------------------------------------------------  1105
                                                                                      
Sbjct 1185  VLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGR  1258

Query 1106  -------------------  1105
                               
Sbjct 1259  FGPFCDPQSTDVISSTQSS  1277