Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12277
• Subject: XM_011524995.3
• Aligned Length: 1695
• Identities: 1411
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT  74

Query   75  CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA  148

Query  149  ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC  222

Query  223  ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA  296

Query  297  CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT  370

Query  371  GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT  444

Query  445  GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCAAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCCAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA  518

Query  519  GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA  592

Query  593  AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA  666

Query  667  GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG  740

Query  741  AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA  814

Query  815  TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC  888

Query  889  TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT  962

Query  963  TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC  1036

Query 1037  CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC  1110

Query 1111  GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATAGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATGGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC  1184

Query 1185  TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC  1258

Query 1259  AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGA-----------------------  1309
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1259  AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGAAGGACGTCCGCTACTTGCACTTC  1332

Query 1310  --------------------------------------------------------------------------  1309
                                                                                      
Sbjct 1333  CTGGAAGGCACCCGGGACTATGAGTGGCTGGAAGCACTGCTTATGAATCAGACGGTGATGTCAAAAAACCTTTT  1406

Query 1310  -------AGGCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACAGGTACCTGTTGCTGCACCCAG  1376
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGGTTCAGGCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACAGGTACCTGTTGCTGCACCCAG  1480

Query 1377  ACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTTCTGAGGTC-------------------------------------  1413
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct 1481  ACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTTCTGAGGTCTAAGACCCTGGATGGTGCCCACTGGAGGATATACCGC  1554

Query 1414  --------------------------------------------------------------------------  1413
                                                                                      
Sbjct 1555  CCCACCACTGGGGCCCTCCTGCTGCTCACTGCCCTTCAGCTCTGTGACCAGAAAGTAAGGACGTGCTTAAAGAA  1628

Query 1414  -------------------------------------------------------------------  1413
                                                                               
Sbjct 1629  TGGAACACATCAAAAGAACACAGAAGCCAGCCTGAAGACGCTCCCACTGGCTCAATACAAGATGATT  1695