Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12306
• Subject: NM_001353703.2
• Aligned Length: 1605
• Identities: 1422
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74

Query   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148

Query  149  ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222

Query  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296

Query  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370

Query  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG--------------------------  418

Query  445  TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC  518
             .|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  -AAGATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC  491

Query  519  CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  565

Query  593  ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC  639

Query  667  AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  713

Query  741  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  787

Query  815  CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG  861

Query  889  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  935

Query  963  GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC  1009

Query 1037  AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1083

Query 1111  GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1181
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGGTCCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1157

Query 1182  TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1231

Query 1256  GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC---  1326
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1232  GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGC  1305

Query 1327  --------------------------------------------------------------------------  1326
                                                                                      
Sbjct 1306  CGGCACCCTGTGCCCGCGCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTCCAATAAACTCCTCCACCCG  1379

Query 1327  --GGCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGC  1398
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CAGGCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGC  1453

Query 1399  ATGAAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC--------------------  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 1454  ATGAAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGCGTC  1527

Query 1453  ---------------------------------------------------  1452
                                                               
Sbjct 1528  CCCCGGGGGAGACCAGGACTCGCACAGGGCAGGATGCTGAACGGGCTACAT  1578