Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12306
- Subject:
- NM_001353713.2
- Aligned Length:
- 1455
- Identities:
- 1335
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
Query 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
Query 149 ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
Query 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
Query 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
Query 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG-------------------------- 418
Query 445 TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC 518
.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 -AAGATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC 491
Query 519 CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 565
Query 593 ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC 639
Query 667 AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 713
Query 741 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 714 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCA---ATGCAGCAGCAAG 784
Query 815 CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG 858
Query 889 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 932
Query 963 GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC 1006
Query 1037 AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1080
Query 1111 GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGGTCCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA 1154
Query 1182 TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT 1255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAA------------- 1215
Query 1256 GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGC 1329
|||
Sbjct 1216 -----------------------------------------------------------------------GGC 1218
Query 1330 TTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219 TTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAA 1292
Query 1404 GAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293 GAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC 1341