Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12306
- Subject:
- NM_001353740.2
- Aligned Length:
- 1635
- Identities:
- 1451
- Gaps:
- 183
Alignment
Query 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
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Sbjct 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
Query 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
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Sbjct 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
Query 149 ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
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Sbjct 149 ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
Query 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
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Sbjct 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
Query 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
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Sbjct 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
Query 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT 444
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Sbjct 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT 444
Query 445 TCAC---ATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGA 515
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Sbjct 445 TCACAAGATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGA 518
Query 516 GGCCTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGA 589
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Sbjct 519 GGCCTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGA 592
Query 590 AGTACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCG 663
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Sbjct 593 AGTACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCG 666
Query 664 TCCAGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCA 737
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Sbjct 667 TCCAGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCA 740
Query 738 GATGGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGC 811
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Sbjct 741 GATGGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGC 814
Query 812 AAGCGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATG 885
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Sbjct 815 AAGCGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATG 888
Query 886 CAGCAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCC 959
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Sbjct 889 CAGCAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCC 962
Query 960 TCCGGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCC 1033
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Sbjct 963 TCCGGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCC 1036
Query 1034 CACAGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCC 1107
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Sbjct 1037 CACAGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCC 1110
Query 1108 ACCGCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGC 1178
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Sbjct 1111 ACCGCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGGTCCAGCTGCCTACCCTGCTGC 1184
Query 1179 CTATGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGG 1252
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Sbjct 1185 CTATGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGG 1258
Query 1253 GCTGTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC 1326
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Sbjct 1259 GCTGTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC 1332
Query 1327 -------------------------------------------------------------------------- 1326
Sbjct 1333 GGCCGGCACCCTGTGCCCGCGCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTCCAATAAACTCCTCCAC 1406
Query 1327 -----GGCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATC 1395
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Sbjct 1407 CCGCAGGCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATC 1480
Query 1396 GGCATGAAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC----------------- 1452
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Sbjct 1481 GGCATGAAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGC 1554
Query 1453 -------------------------------------------------------------------------- 1452
Sbjct 1555 GTCCCCCGGGGGAGACCAGGACTCGCACAGGGCCAGTCAAATCCACCACAGTCTCGCGCTGAGCTAGGAATAAA 1628
Query 1453 ------- 1452
Sbjct 1629 GTTCACG 1635