Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12356
- Subject:
- NM_020750.3
- Aligned Length:
- 3612
- Identities:
- 2004
- Gaps:
- 1608
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGATGGATCAAGTAAACGCGCTGTGCGAGCAGCTGGTGAAAGCGGTGACGGTCATGATGGACCCCAACTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CACCCAGCGCTACCGGCTGGAAGCCCTCAAGTTTTGTGAGGAGTTTAAAGAAAAGTGTCCTATCTGTGTCCCCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGGCTTGAGGTTGGCTGAGAAAACACAAGTTGCCATCGTCAGACATTTTGGCCTTCAGATCCTGGAACACGTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTCAAGTTTCGGTGGAACGGCATGTCTCGATTGGAGAAGGTGTATCTGAAGAACAGTGTCATGGAGCTGATTGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AAATGGAACATTGAACATTTTGGAAGAGGAGAACCATATTAAAGATGCTCTGTCTCGAATTGTAGTGGAAATGA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TCAAGCGAGAGTGGCCACAGCATTGGCCTGACATGCTAATAGAATTGGACACTCTTTCCAAACAAGGGGAAACA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CAGACAGAATTGGTGATGTTTATCCTTTTGCGACTGGCAGAGGATGTAGTGACTTTTCAGACACTTCCCCCTCA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AAGAAGAAGGGACATCCAGCAAACATTAACCCAGAACATGGAAAGGATCTTCAGTTTTCTGCTTAACACACTTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 AAGAAAATGTAAACAAGTATCAGCAAGTGAAGACAGATACTTCTCAGGAGTCAAAGGCGCAAGCAAACTGTCGA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GTAGGAGTTGCAGCACTGAATACTCTAGCAGGCTATATTGACTGGGTGTCTATGAGTCACATCACTGCTGAAAA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CTGTAAACTCCTGGAGATACTGTGTTTGCTGTTGAATGAACAGGAACTTCAGTTGGGAGCCGCTGAGTGTCTTC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TCATTGCAGTCAGCAGAAAAGGCAAGTTGGAAGACCGGAAGCCCTTGATGGTCTTATTTGGAGATGTTGCCATG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CATTATATACTCTCCGCCGCACAGACTGCTGATGGAGGAGGTTTGGTAGAAAAACACTACGTCTTTCTGAAGAG 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 GCTCTGTCAGGTGTTGTGTGCGCTGGGCAATCAGCTGTGTGCATTGCTGGGTGCAGATTCTGATGTAGAAACAC 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 CATCAAACTTTGGAAAATACCTGGAATCTTTTCTTGCTTTCACAACCCATCCAAGTCAGTTTCTACGCTCTTCA 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 ACTCAGATGACTTGGGGAGCCCTCTTCAGGCATGAAATCCTGTCCCGTGATCCTTTGCTATTAGCAATAATACC 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 AAAATATCTTCGTGCTTCCATGACTAACTTGGTCAAGATGGGCTTTCCTTCTAAAACAGACAGCCCTAGCTGTG 1258
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1259 AATATTCTCGGTTTGATTTTGATAGCGATGAGGACTTCAATGCTTTCTTCAACTCCTCCCGAGCACAACAAGGA 1332
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1333 GAGGTGATGAGGTTGGCATGTCGTTTGGATCCCAAAACTAGCTTCCAGATGGCTGGGGAGTGGCTAAAGTATCA 1406
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1407 ACTATCAACTTTTCTTGATGCTGGTTCTGTGAATTCTTGTTCTGCAGTTGGAACTGGAGAAGGAAGCCTCTGTT 1480
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1481 CCGTCTTCTCACCTTCATTCGTGCAGTGGGAAGCCATGACTCTTTTTTTGGAAAGTGTTATCACCCAGATGTTT 1554
Query 1 ------------------------------------------------------ATGGTTCTGAACTTTGATAC 20
||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGAACACTAAATAGAGAAGAAATTCCTGTTAATGATGGAATAGAGCTATTGCAGATGGTTCTGAACTTTGATAC 1628
Query 21 CAAGGATCCCCTCATCCTGTCCTGCGTCCTTACTAATGTCTCTGCACTCTTTCCATTTGTCACCTACAGACCAG 94
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAGGATCCCCTCATCCTGTCCTGCGTCCTTACTAATGTCTCTGCACTCTTTCCATTTGTCACCTACAGACCAG 1702
Query 95 AGTTCCTGCCCCAGGTCTTCTCTAAGCTATTTTCATCTGTCACTTTTGAAACTGTTGAAGAAAGTAAGGCCCCC 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGTTCCTGCCCCAGGTCTTCTCTAAGCTATTTTCATCTGTCACTTTTGAAACTGTTGAAGAAAGTAAGGCCCCC 1776
Query 169 AGAACCCGGGCAGTGAGGAATGTGAGGAGGCATGCTTGTTCCTCCATCATCAAGATGTGTCGTGACTACCCCCA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGAACCCGGGCAGTGAGGAATGTGAGGAGGCATGCTTGTTCCTCCATCATCAAGATGTGTCGTGACTACCCCCA 1850
Query 243 GCTTGTGCTGCCCAATTTTGACATGCTTTATAACCATGTGAAGCAACTCCTCTCCAATGAGCTACTCCTGACAC 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCTTGTGCTGCCCAATTTTGACATGCTTTATAACCATGTGAAGCAACTCCTCTCCAATGAGCTACTCCTGACAC 1924
Query 317 AAATGGAGAAGTGTGCCCTCATGGAAGCCCTGGTTCTCATTAGCAACCAATTTAAGAACTACGAGCGTCAGAAG 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAATGGAGAAGTGTGCCCTCATGGAAGCCCTGGTTCTCATTAGCAACCAATTTAAGAACTACGAGCGTCAGAAG 1998
Query 391 GTGTTCCTAGAGGAGCTGATGGCACCAGTGGCCAGCATCTGGCTTTCTCAAGACATGCACAGAGTGCTGTCAGA 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGTTCCTAGAGGAGCTGATGGCACCAGTGGCCAGCATCTGGCTTTCTCAAGACATGCACAGAGTGCTGTCAGA 2072
Query 465 TGTTGATGCTTTCATTGCGTATGTGGGTACAGATCAGAAGAGCTGTGACCCAGGCCTGGAGGATCCGTGTGGCT 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGTTGATGCTTTCATTGCGTATGTGGGTACAGATCAGAAGAGCTGTGACCCAGGCCTGGAGGATCCGTGTGGCT 2146
Query 539 TAAACCGTGCACGAATGAGCTTTTGTGTATACAGCATTCTGGGTGTGGTGAAACGAACTTGCTGGCCCACTGAC 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TAAACCGTGCACGAATGAGCTTTTGTGTATACAGCATTCTGGGTGTGGTGAAACGAACTTGCTGGCCCACTGAC 2220
Query 613 CTAGAAGAGGCCAAAGCTGGGGGATTTGTGGTGGGTTATACATCCAGTGGAAATCCAATCTTCCGTAACCCCTG 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTAGAAGAGGCCAAAGCTGGGGGATTTGTGGTGGGTTATACATCCAGTGGAAATCCAATCTTCCGTAACCCCTG 2294
Query 687 CACAGAGCAGATTCTGAAACTTCTTGACAATTTGCTTGCGCTTATAAGAACCCACAATACATTATATGCACCAG 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CACAGAGCAGATTCTGAAACTTCTTGACAATTTGCTTGCGCTTATAAGAACCCACAATACATTATATGCACCAG 2368
Query 761 AAATGCTAGCCAAAATGGCAGAGCCTTTCACCAAGGCTCTGGATATGCTTGACGCGGAAAAATCTGCTATATTA 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAATGCTAGCCAAAATGGCAGAGCCTTTCACCAAGGCTCTGGATATGCTTGACGCGGAAAAATCTGCTATATTA 2442
Query 835 GGATTACCTCAACCTCTCTTGGAACTCAATGACTCTCCTGTCTTCAAAACCGTCTTGGAAAGAATGCAGCGTTT 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGATTACCTCAACCTCTCTTGGAACTCAATGACTCTCCTGTCTTCAAAACCGTCTTGGAAAGAATGCAGCGTTT 2516
Query 909 CTTCTCTACCCTCTATGAAAACTGTTTTCATATCCTAGGGAAGGCAGGCCCTTCCATGCAGCAAGACTTCTATA 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTTCTCTACCCTCTATGAAAACTGTTTTCATATCCTAGGGAAGGCAGGCCCTTCCATGCAGCAAGACTTCTATA 2590
Query 983 CTGTGGAGGACCTTGCTACCCAGCTTCTCAGCTCAGCCTTTGTCAACTTGAACAATATTCCTGACTACCGACTC 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTGTGGAGGACCTTGCTACCCAGCTTCTCAGCTCAGCCTTTGTCAACTTGAACAATATTCCTGACTACCGACTC 2664
Query 1057 AGACCCATGCTTCGTGTCTTTGTAAAGCCTCTGGTGCTCTTCTGTCCCCCAGAGCACTATGAAGCCCTGGTATC 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGACCCATGCTTCGTGTCTTTGTAAAGCCTCTGGTGCTCTTCTGTCCCCCAGAGCACTATGAAGCCCTGGTATC 2738
Query 1131 CCCCATCCTCGGACCTCTTTTCACCTACCTCCATATGAGGCTTTCTCAGAAATGGCAAGTTATCAACCAAAGGA 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCCCATCCTCGGACCTCTTTTCACCTACCTCCATATGAGGCTTTCTCAGAAATGGCAAGTTATCAACCAAAGGA 2812
Query 1205 GCCTGCTGTGTGGAGAAGATGAGGCTGCAGATGAAAACCCAGAGTCTCAAGAGATGCTGGAGGAGCAACTGGTG 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GCCTGCTGTGTGGAGAAGATGAGGCTGCAGATGAAAACCCAGAGTCTCAAGAGATGCTGGAGGAGCAACTGGTG 2886
Query 1279 AGGATGTTAACCCGAGAAGTCATGGACCTAATCACGGTTTGCTGTGTTTCAAAGAAGGGTGCTGACCACAGTAG 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGGATGTTAACCCGAGAAGTCATGGACCTAATCACGGTTTGCTGTGTTTCAAAGAAGGGTGCTGACCACAGTAG 2960
Query 1353 TGCTCCCCCAGCAGATGGAGACGATGAAGAAATGATGGCCACAGAGGTCACCCCCTCAGCTATGGCAGAGCTTA 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGCTCCCCCAGCAGATGGAGACGATGAAGAAATGATGGCCACAGAGGTCACCCCCTCAGCTATGGCAGAGCTTA 3034
Query 1427 CAGACCTGGGCAAATGTCTGATGAAGCATGAGGATGTTTGTACAGCGCTATTAATTACAGCCTTCAATTCCCTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CAGACCTGGGCAAATGTCTGATGAAGCATGAGGATGTTTGTACAGCGCTATTAATTACAGCCTTCAATTCCCTG 3108
Query 1501 GCCTGGAAAGATACTCTGTCCTGCCAGAGGACAACCTCACAGCTCTGCTGGCCTCTCCTCAAACAAGTGCTGTC 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GCCTGGAAAGATACTCTGTCCTGCCAGAGGACAACCTCACAGCTCTGCTGGCCTCTCCTCAAACAAGTGCTGTC 3182
Query 1575 AGGGACACTGCTCGCAGATGCAGTTACGTGGCTTTTCACCAGTGTGCTGAAAGGCTTACAGATGCACGGGCAGC 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGGGACACTGCTCGCAGATGCAGTTACGTGGCTTTTCACCAGTGTGCTGAAAGGCTTACAGATGCACGGGCAGC 3256
Query 1649 ACGACGGGTGCATGGCTTCCCTGGTCCATCTGGCCTTCCAGATATACGAGGCACTGCGCCCCAGGTACCTGGAG 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 ACGACGGGTGCATGGCTTCCCTGGTCCATCTGGCCTTCCAGATATACGAGGCACTGCGCCCCAGGTACCTGGAG 3330
Query 1723 ATAAGAGCTGTAATGGAGCAAATCCCTGAAATACAGAAGGACTCACTGGACCAGTTTGACTGCAAGCTTTTAAA 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATAAGAGCTGTAATGGAGCAAATCCCTGAAATACAGAAGGACTCACTGGACCAGTTTGACTGCAAGCTTTTAAA 3404
Query 1797 CCCCTCCCTGCAGAAAGTGGCTGACAAGCGCCGAAAGGACCAATTCAAACGCCTCATTGCTGGTTGCATTGGGA 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CCCCTCCCTGCAGAAAGTGGCTGACAAGCGCCGAAAGGACCAATTCAAACGCCTCATTGCTGGTTGCATTGGGA 3478
Query 1871 AACCCTTGGGAGAGCAGTTCCGAAAAGAAGTTCACATTAAGAATCTTCCCTCACTTTTCAAAAAAACAAAGCCA 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 AACCCTTGGGAGAGCAGTTCCGAAAAGAAGTTCACATTAAGAATCTTCCCTCACTTTTCAAAAAAACAAAGCCA 3552
Query 1945 ATGCTGGAGACGGAGGTGCTGGACAATGATGGGGGTGGCCTGGCCACCATCTTTGAACCC 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 ATGCTGGAGACGGAGGTGCTGGACAATGATGGGGGTGGCCTGGCCACCATCTTTGAACCC 3612
