Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12372
Subject:
NM_001303514.1
Aligned Length:
775
Identities:
660
Gaps:
115

Alignment

Query   1  MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVIQVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQT  74
           ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct   1  MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQ------------------------------------------------------  20

Query  75  DITFEHIMALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPPISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKL  148
                                                                        |||||||||||||
Sbjct  21  -------------------------------------------------------------EVELYKSSHRDKL  33

Query 149  GLMVCYRTDDEEDLGIYVGEVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPES  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  34  GLMVCYRTDDEEDLGIYVGEVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPES  107

Query 223  QLAKRWKDSDRDDFLDDFGSENEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108  QLAKRWKDSDRDDFLDDFGSENEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNE  181

Query 297  ESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIK  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182  ESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIK  255

Query 371  CHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRNESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256  CHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRNESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEE  329

Query 445  SLYDLAASEPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNSNLNRTPPGPAVA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  SLYDLAASEPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNSNLNRTPPGPAVA  403

Query 519  TPAKAAPPPGSPAKFRSLSRDPEAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQ  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404  TPAKAAPPPGSPAKFRSLSRDPEAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQ  477

Query 593  LAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGM  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478  LAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGM  551

Query 667  TTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNK  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552  TTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNK  625

Query 741  KILDNWITIQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV  775
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626  KILDNWITIQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV  660