Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12372
- Subject:
- NM_001303516.1
- Aligned Length:
- 2325
- Identities:
- 2064
- Gaps:
- 261
Alignment
Query 1 ATGGGATGTAATATGTGCGTGGTCCAGAAACCGGAGGAGCAGTACAAAGTGATGCTGCAGGTGAACGGGAAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTCTCCAAGCTGTCTCAGGAGCAAACTCTGCAGGCCCTGCGCTCCTCCAAGGAGCCCCTGGTGATCCAGGTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGAGACGCAGCCCCCGCCTCCGGGGGGACAGCTCCTGTCACGACCTGCAGCTGGTGGACAGTGGCACTCAGACC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACATCACCTTCGAGCATATCATGGCGCTGGGCAAGCTGCGTCCGCCCACCCCGCCCATGGTCATCCTGGAGCC 296
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Sbjct 1 ---------------------ATGGCGCTGGGCAAGCTGCGTCCGCCCACCCCGCCCATGGTCATCCTGGAGCC 53
Query 297 GTACGTCCTCTCTGAGCTCCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCCGC 370
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Sbjct 54 ------------------CCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCCGC 109
Query 371 AGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGCTG 444
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Sbjct 110 AGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGCTG 183
Query 445 GGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAACAG 518
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Sbjct 184 GGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAACAG 257
Query 519 CATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAACC 592
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Sbjct 258 CATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAACC 331
Query 593 GGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGAGT 666
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Sbjct 332 GGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGAGT 405
Query 667 CAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGGGA 740
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Sbjct 406 CAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGGGA 479
Query 741 GCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGATG 814
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Sbjct 480 GCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGATG 553
Query 815 CCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACGAA 888
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Sbjct 554 CCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACGAA 627
Query 889 GAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAGTT 962
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Sbjct 628 GAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAGTT 701
Query 963 TGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGCGG 1036
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Sbjct 702 TGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGCGG 775
Query 1037 GGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCAAG 1110
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Sbjct 776 GGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCAAG 849
Query 1111 TGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGACGT 1184
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Sbjct 850 TGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGACGT 923
Query 1185 CAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTGCC 1258
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Sbjct 924 CAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTGCC 997
Query 1259 GCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGGAG 1332
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Sbjct 998 GCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGGAG 1071
Query 1333 AGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAGTC 1406
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Sbjct 1072 AGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAGTC 1145
Query 1407 GGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCTGC 1480
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Sbjct 1146 GGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCTGC 1219
Query 1481 CCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTGCC 1554
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Sbjct 1220 CCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTGCC 1293
Query 1555 ACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCCGG 1628
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Sbjct 1294 ACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCCGG 1367
Query 1629 CCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCCTG 1702
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Sbjct 1368 CCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCCTG 1441
Query 1703 AAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGCAG 1776
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Sbjct 1442 AAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGCAG 1515
Query 1777 CTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGCGG 1850
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Sbjct 1516 CTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGCGG 1589
Query 1851 GGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTACG 1924
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Sbjct 1590 GGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTACG 1663
Query 1925 TGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTATG 1998
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Sbjct 1664 TGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTATG 1737
Query 1999 ACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCACCT 2072
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Sbjct 1738 ACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCACCT 1811
Query 2073 GATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCAGC 2146
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Sbjct 1812 GATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCAGC 1885
Query 2147 AGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACAAG 2220
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Sbjct 1886 AGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACAAG 1959
Query 2221 AAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGGGT 2294
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Sbjct 1960 AAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGGGT 2033
Query 2295 CTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG 2325
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Sbjct 2034 CTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG 2064