Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12372
• Subject: NM_001303516.1
• Aligned Length: 775
• Identities: 688
• Gaps: 87

Alignment

Query   1  MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVIQVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  DITFEHIMALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPPISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKL  148
                  ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------MALGKLRPPTPPMVILEP------PPISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKL  61

Query 149  GLMVCYRTDDEEDLGIYVGEVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPES  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  62  GLMVCYRTDDEEDLGIYVGEVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPES  135

Query 223  QLAKRWKDSDRDDFLDDFGSENEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136  QLAKRWKDSDRDDFLDDFGSENEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVGRTDESTRNE  209

Query 297  ESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIK  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210  ESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIK  283

Query 371  CHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRNESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284  CHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRNESLGHEMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEE  357

Query 445  SLYDLAASEPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNSNLNRTPPGPAVA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358  SLYDLAASEPKKHELSDISELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNSNLNRTPPGPAVA  431

Query 519  TPAKAAPPPGSPAKFRSLSRDPEAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQ  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432  TPAKAAPPPGSPAKFRSLSRDPEAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQ  505

Query 593  LAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGM  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506  LAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGM  579

Query 667  TTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNK  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580  TTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNK  653

Query 741  KILDNWITIQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV  775
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654  KILDNWITIQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV  688