Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12372
• Subject: NM_032512.4
• Aligned Length: 2325
• Identities: 2307
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGGATGTAATATGTGCGTGGTCCAGAAACCGGAGGAGCAGTACAAAGTGATGCTGCAGGTGAACGGGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGATGTAATATGTGCGTGGTCCAGAAACCGGAGGAGCAGTACAAAGTGATGCTGCAGGTGAACGGGAAGGA  74

Query   75  GCTCTCCAAGCTGTCTCAGGAGCAAACTCTGCAGGCCCTGCGCTCCTCCAAGGAGCCCCTGGTGATCCAGGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCTCCAAGCTGTCTCAGGAGCAAACTCTGCAGGCCCTGCGCTCCTCCAAGGAGCCCCTGGTGATCCAGGTGC  148

Query  149  TGAGACGCAGCCCCCGCCTCCGGGGGGACAGCTCCTGTCACGACCTGCAGCTGGTGGACAGTGGCACTCAGACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGACGCAGCCCCCGCCTCCGGGGGGACAGCTCCTGTCACGACCTGCAGCTGGTGGACAGTGGCACTCAGACC  222

Query  223  GACATCACCTTCGAGCATATCATGGCGCTGGGCAAGCTGCGTCCGCCCACCCCGCCCATGGTCATCCTGGAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACATCACCTTCGAGCATATCATGGCGCTGGGCAAGCTGCGTCCGCCCACCCCGCCCATGGTCATCCTGGAGCC  296

Query  297  GTACGTCCTCTCTGAGCTCCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCCGC  370
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ------------------CCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCCGC  352

Query  371  AGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  AGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGCTG  426

Query  445  GGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAACAG  500

Query  519  CATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  CATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAACC  574

Query  593  GGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  GGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGAGT  648

Query  667  CAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  CAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGGGA  722

Query  741  GCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  GCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGATG  796

Query  815  CCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  CCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACGAA  870

Query  889  GAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  GAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAGTT  944

Query  963  TGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGCGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGCGG  1018

Query 1037  GGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  GGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCAAG  1092

Query 1111  TGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  TGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGACGT  1166

Query 1185  CAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  CAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTGCC  1240

Query 1259  GCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  GCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGGAG  1314

Query 1333  AGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAGTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  AGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAGTC  1388

Query 1407  GGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  GGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCTGC  1462

Query 1481  CCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  CCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTGCC  1536

Query 1555  ACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCCGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  ACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCCGG  1610

Query 1629  CCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611  CCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCCTG  1684

Query 1703  AAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685  AAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGCAG  1758

Query 1777  CTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGCGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1759  CTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGCGG  1832

Query 1851  GGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTACG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833  GGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTACG  1906

Query 1925  TGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTATG  1998
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Sbjct 1907  TGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTATG  1980

Query 1999  ACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCACCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981  ACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCACCT  2054

Query 2073  GATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCAGC  2146
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Sbjct 2055  GATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCAGC  2128

Query 2147  AGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129  AGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACAAG  2202

Query 2221  AAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGGGT  2294
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Sbjct 2203  AAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGGGT  2276

Query 2295  CTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG  2325
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277  CTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG  2307