Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12415
- Subject:
- NM_001363098.2
- Aligned Length:
- 1680
- Identities:
- 1530
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCAGCCAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGCCCCTGTCGTTCCAGGCCAAGCTGACCTTCGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGATGTGGCTGTGCTCCTCTCCCAGGATGAATGGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAATG 148
Query 1 --ATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG 72
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTG 222
Query 73 GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCGAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTC 296
Query 147 AGACAACCTCAAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAA 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGACAACCTCAAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAA 370
Query 221 CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGGGAGAGAGTCAAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAA 444
Query 295 ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACCCTTGGGGAGGATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGA 518
Query 369 CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGC 592
Query 443 CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT 666
Query 517 GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAG 740
Query 591 AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTC 814
Query 665 AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCATCACAAGATACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCA 888
Query 739 CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATCTCATTCAGCACCAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAA 962
Query 813 CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCATAGCACTGTTCTGCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGA 1036
Query 887 AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAACCTTCAGTGTGAAGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGC 1110
Query 961 GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTA 1184
Query 1035 TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGG 1258
Query 1109 AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAAGCCCTATGCATGCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTC 1332
Query 1183 CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACACTGGGGAGAAGCCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCA 1406
Query 1257 TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAGAGAATCCACACAGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTC 1480
Query 1331 TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGATTGTGCACCTGAGGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAG 1554
Query 1405 TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TACTCAGTGCTCATCCAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGC 1628
Query 1479 CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTTCAACCAGCATGGCCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1680