Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12415
• Subject: NM_001363100.2
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1530
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAGCAGCCAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGGCCAAGCTGACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCT  74

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGATGGAAACCT  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct   75  CCTCTCCCAGGATGAATGGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAATGTGATGATGGAAACCT  148

Query   14  ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT  222

Query   88  CCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTCAAATA  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTCAAATA  296

Query  162  TGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGAGAGTC  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGAGAGTC  370

Query  236  AAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACACCCTTGGGGAGG  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACACCCTTGGGGAGG  444

Query  310  ATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGACCACCGTGAAGTTCA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGACCACCGTGAAGTTCA  518

Query  384  GGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGCCCTACATGTGTGTTG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGCCCTACATGTGTGTTG  592

Query  458  AGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTAT  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTAT  666

Query  532  GTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAGAATTCACACAGGTGA  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAGAATTCACACAGGTGA  740

Query  606  GAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTCAGCATCACAAGATAC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTCAGCATCACAAGATAC  814

Query  680  ATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCACATCTCATTCAGCAC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCACATCTCATTCAGCAC  888

Query  754  CAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAACCATAGCACTGTTCT  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAACCATAGCACTGTTCT  962

Query  828  GCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGAAAACCTTCAGTGTGA  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGAAAACCTTCAGTGTGA  1036

Query  902  AGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCC  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCC  1110

Query  976  TTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGAGTG  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGAGTG  1184

Query 1050  TGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGGAAAAGCCCTATGCAT  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGGAAAAGCCCTATGCAT  1258

Query 1124  GCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTCCACACTGGGGAGAAG  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTCCACACTGGGGAGAAG  1332

Query 1198  CCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCATGAGAGAATCCACAC  1271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCATGAGAGAATCCACAC  1406

Query 1272  AGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTCTGATTGTGCACCTGA  1345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTCTGATTGTGCACCTGA  1480

Query 1346  GGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAGTACTCAGTGCTCATC  1419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAGTACTCAGTGCTCATC  1554

Query 1420  CAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGCCTTCAACCAGCATGG  1493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGCCTTCAACCAGCATGG  1628

Query 1494  CCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG  1530
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG  1665