Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12415
- Subject:
- NM_001363107.2
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1467
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCAGCCAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGGCCAAGCTGACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGATGGAAACCT 13
|||||||||||||
Sbjct 75 CCTCTCCCAGGATGAATGGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAATGTGATGATGGAAACCT 148
Query 14 ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGGAATGTAGTCTCATTGGGACTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGCGAGGGGAAGAT 222
Query 88 CCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTCAAATA 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAAGAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCA-------------- 282
Query 162 TGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTTTATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGAGAGTC 235
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 -------------------------------------------------GAATGTGAAACCAAGGGAGAGAGTC 307
Query 236 AAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACACCCTTGGGGAGG 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 AAAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAAACAGTGATTCTGGGGAAAACACCCTTGGGGAGG 381
Query 310 ATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGACCACCGTGAAGTTCA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 ATTGATCAAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCCAAACTCTGTTGACCACCGTGAAGTTCA 455
Query 384 GGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGCCCTACATGTGTGTTG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 GGTCTTAAGCCAAAGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAGAGAGGCCCTACATGTGTGTTG 529
Query 458 AGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTAT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 AGTGTGGGAAGTGCTTTGGCCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTAT 603
Query 532 GTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAGAATTCACACAGGTGA 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 GTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAGAATTCACACAGGTGA 677
Query 606 GAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTCAGCATCACAAGATAC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 GAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAAGCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTCAGCATCACAAGATAC 751
Query 680 ATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCACATCTCATTCAGCAC 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 ATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCGGAAAGCCTTCACTCAACTCTCACATCTCATTCAGCAC 825
Query 754 CAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAACCATAGCACTGTTCT 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 CAGCGGATCCACACGGGAGAAAGGCCATATGTGTGTCCGTTGTGTGGGAAAGCCTTCAACCATAGCACTGTTCT 899
Query 828 GCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGAAAACCTTCAGTGTGA 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCGGAGCCACCAGAGGGTACACACTGGGGAGAAGCCTCACAGGTGCAATGAGTGTGGGAAAACCTTCAGTGTGA 973
Query 902 AGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCC 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 AGAGGACACTGCTGCAGCACCAGAGGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACACGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCC 1047
Query 976 TTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGAGTG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 TTCAGCGACCGCTCAGTCCTCATTCAGCACCACAACGTGCACACCGGGGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGAGTG 1121
Query 1050 TGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGGAAAAGCCCTATGCAT 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 TGGGAAGACCTTCAGCCACCGCTCCACACTGATGAATCACGAGCGGATCCACACCGAGGAAAAGCCCTATGCAT 1195
Query 1124 GCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTCCACACTGGGGAGAAG 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 GCTACGAATGTGGGAAGGCCTTCGTTCAGCACTCACACCTGATCCAGCACCAGAGAGTCCACACTGGGGAGAAG 1269
Query 1198 CCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCATGAGAGAATCCACAC 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 CCCTATGTGTGTGGTGAATGTGGGCACGCCTTCAGTGCACGCCGGTCTCTGATCCAGCATGAGAGAATCCACAC 1343
Query 1272 AGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTCTGATTGTGCACCTGA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 AGGTGAAAAGCCCTTCCAGTGCACAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCTGAAAGCAACTCTGATTGTGCACCTGA 1417
Query 1346 GGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAGTACTCAGTGCTCATC 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418 GGACCCACACGGGCGAGAAGCCATATGAGTGCAATAGCTGCGGGAAGGCCTTCAGCCAGTACTCAGTGCTCATC 1491
Query 1420 CAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGCCTTCAACCAGCATGG 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 CAGCACCAGCGGATCCACACAGGCGAGAAGCCCTATGAGTGCGGGGAGTGTGGGCGTGCCTTCAACCAGCATGG 1565
Query 1494 CCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1530
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 CCACCTAATCCAGCACCAGAAAGTGCACAGAAAGTTG 1602