Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12427
• Subject: XM_011533011.3
• Aligned Length: 2705
• Identities: 2125
• Gaps: 580

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCTGCGCTGTGGGGGATTGCTGTTCAGTTCTCGCTTTGATTCAGGGAATCTAGCCCACGTGGAGAAGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATCTTTGTCCAGTGATGGGGAAGGGGTAGGAGGTGGGGCGTCAGCCCTGACCAGTGGCATTGCCTCTTCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTGACTATGAATTCAACGTGTGGACCCGACCAGACTGTGCTGAAACGGAATTTGAGAATGGGAACAGGTCATGG  222

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAACATGAACAAGCAGAG  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTACTTCAGCGTCCGGGGAGGAATGCCAGGAAAACTCATCAAGATCAACATTATGAACATGAACAAGCAGAG  296

Query   21  CAAGCTGTATTCCCAGGGCATGGCCCCCTTTGTGCGCACACTGCCCACCCGGCCACGCTGGGAACGCATTCGAG  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGCTGTATTCCCAGGGCATGGCCCCCTTTGTGCGCACACTGCCCACCCGGCCACGCTGGGAACGCATTCGAG  370

Query   95  ACCGGCCCACCTTTGAGATGACAGAGACGCAGTTTGTGTTATCCTTTGTTCATCGTTTCGTGGAGGGCCGTGGG  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCGGCCCACCTTTGAGATGACAGAGACGCAGTTTGTGTTATCCTTTGTTCATCGTTTCGTGGAGGGCCGTGGG  444

Query  169  GCCACCACCTTCTTCGCCTTCTGCTACCCCTTCTCCTACAGTGACTGCCAGGAACTGCTAAACCAGCTAGACCA  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCACCACCTTCTTCGCCTTCTGCTACCCCTTCTCCTACAGTGACTGCCAGGAACTGCTAAACCAGCTAGACCA  518

Query  243  GCGCTTTCCGGAGAACCACCCTACCCATAGCAGCCCCCTGGATACCATCTATTACCATCGGGAGCTCCTTTGCT  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGCTTTCCGGAGAACCACCCTACCCATAGCAGCCCCCTGGATACCATCTATTACCATCGGGAGCTCCTTTGCT  592

Query  317  ATTCTCTGGATGGACTTCGTGTAGATCTGCTGACGATCACTTCCTGCCATGGGCTTCGAGAAGATCGAGAGCCC  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCTCTGGATGGACTTCGTGTAGATCTGCTGACGATCACTTCCTGCCATGGGCTTCGAGAAGATCGAGAGCCC  666

Query  391  CGTCTAGAGCAGCTATTTCCTGATACCAGCACCCCTCGACCATTCCGTTTCGCAGGCAAGAGGATATTCTTCTT  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTCTAGAGCAGCTATTTCCTGATACCAGCACCCCTCGACCATTCCGTTTCGCAGGCAAGAGGATATTCTTCTT  740

Query  465  AAGCAGTAGAGTACACCCAGGGGAGACTCCATCTAGCTTTGTCTTCAATGGCTTTCTGGACTTCATCCTCCGAC  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGCAGTAGAGTACACCCAGGGGAGACTCCATCTAGCTTTGTCTTCAATGGCTTTCTGGACTTCATCCTCCGAC  814

Query  539  CTGATGATCCCCGGGCCCAAACCCTCCGTCGCCTCTTCGTCTTTAAGCTGATTCCCATGTTGAACCCCGATGGT  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGATGATCCCCGGGCCCAAACCCTCCGTCGCCTCTTCGTCTTTAAGCTGATTCCCATGTTGAACCCCGATGGT  888

Query  613  GTGGTCCGGGGACACTACCGCACAGACTCACGTGGAGTGAATCTGAACCGTCAGTACCTGAAGCCTGATGCCGT  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGTCCGGGGACACTACCGCACAGACTCACGTGGAGTGAATCTGAACCGTCAGTACCTGAAGCCTGATGCCGT  962

Query  687  CCTGCACCCGGCCATCTATGGGGCCAAAGCTGTGCTTCTCTACCACCATGTGCACTCTCGTCTGAACTCCCAGA  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGCACCCGGCCATCTATGGGGCCAAAGCTGTGCTTCTCTACCACCATGTGCACTCTCGTCTGAACTCCCAGA  1036

Query  761  GTTCCTCTGAGCACCAGCCCAGTTCCTGTCTCCCTCCTGATGCTCCTGTTTCTGACCTGGAGAAAGCCAACAAT  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTCCTCTGAGCACCAGCCCAGTTCCTGTCTCCCTCCTGATGCTCCTGTTTCTGACCTGGAGAAAGCCAACAAT  1110

Query  835  CTCCAAAATGAAGCTCAGTGTGGGCACTCAGCTGACAGGCATAACGCTGAAGCCTGGAAACAAACAGAGCCAGC  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCCAAAATGAAGCTCAGTGTGGGCACTCAGCTGACAGGCATAACGCTGAAGCCTGGAAACAAACAGAGCCAGC  1184

Query  909  AGAACAGAAGCTCAACAGTGTGTGGATTATGCCACAACAGTCTGCGGGGCTTGAAGAGTCAGCCCCTGATACCA  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAACAGAAGCTCAACAGTGTGTGGATTATGCCACAACAGTCTGCGGGGCTTGAAGAGTCAGCCCCTGATACCA  1258

Query  983  TCCCCCCCAAAGAGAGTGGCGTTGCTTACTATGTGGACCTGCATGGACATGCTTCCAAAAGGGGCTGCTTCATG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCCCCCAAAGAGAGTGGCGTTGCTTACTATGTGGACCTGCATGGACATGCTTCCAAAAGGGGCTGCTTCATG  1332

Query 1057  TACGGAAACAGCTTTAGTGATGAGAGCACCCAGGTGGAAAACATGCTATATCCAAAGCTCATCTCCTTGAATTC  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACGGAAACAGCTTTAGTGATGAGAGCACCCAGGTGGAAAACATGCTATATCCAAAGCTCATCTCCTTGAATTC  1406

Query 1131  AGCCCACTTCGACTTCCAGGGCTGCAATTTCTCAGAGAAGAATATGTATGCCCGAGACCGTAGAGATGGCCAGT  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCCACTTCGACTTCCAGGGCTGCAATTTCTCAGAGAAGAATATGTATGCCCGAGACCGTAGAGATGGCCAGT  1480

Query 1205  CTAAAGAGGGAAGCGGCCGTGTTGCAATCTACAAAGCCTCAGGGATAATCCACAGCTACACACTTGAATGCAAC  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAAAGAGGGAAGCGGCCGTGTTGCAATCTACAAAGCCTCAGGGATAATCCACAGCTACACACTTGAATGCAAC  1554

Query 1279  TACAACACTGGACGCTCAGTAAACAGCATCCCTGCTGCCTGCCATGACAATGGGCGTGCCAGCCCCCCTCCCCC  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACAACACTGGACGCTCAGTAAACAGCATCCCTGCTGCCTGCCATGACAATGGGCGTGCCAGCCCCCCTCCCCC  1628

Query 1353  GCCGGCTTTCCCCTCCAGATACACTGTGGAACTATTTGAGCAGGTGGGACGAGCTATGGCCATTGCAGCCCTGG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCGGCTTTCCCCTCCAGATACACTGTGGAACTATTTGAGCAGGTGGGACGAGCTATGGCCATTGCAGCCCTGG  1702

Query 1427  ACATGGCGGAATGTAATCCGTGGCCCCGAATTGTACTGTCAGAGCACAGCAGCCTTACTAATCTACGGGCCTGG  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACATGGCGGAATGTAATCCGTGGCCCCGAATTGTACTGTCAGAGCACAGCAGCCTTACTAATCTACGGGCCTGG  1776

Query 1501  ATGCTGAAACATGTACGCAACAGCCGAGGCCTAAGCAGCACTCTGAATGTGGGTGTCAACAAGAAGAGGGGCCT  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGCTGAAACATGTACGCAACAGCCGAGGCCTAAGCAGCACTCTGAATGTGGGTGTCAACAAGAAGAGGGGCCT  1850

Query 1575  TCGAACTCCACCCAAAAGTCACAATGGGTTGCCTGTCTCCTGCTCCGAAAACACCTTGAGTCGGGCACGAAGTT  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCGAACTCCACCCAAAAGTCACAATGGGTTGCCTGTCTCCTGCTCCGAAAACACCTTGAGTCGGGCACGAAGTT  1924

Query 1649  TTAGCACCGGCACAAGTGCCGGTGGTAGCAGCAGCAGCCAACAAAATTCTCCACAGATGAAGAATTCCCCCAGC  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTAGCACCGGCACAAGTGCCGGTGGTAGCAGCAGCAGCCAACAAAATTCTCCACAGATGAAGAATTCCCCCAGC  1998

Query 1723  TTTCCTTTTCATGGCAGTCGGCCTGCAGGGCTGCCAGGCCTGGGCTCTAGTACCCAAAAGGTCACCCACCGGGT  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTTCCTTTTCATGGCAGTCGGCCTGCAGGGCTGCCAGGCCTGGGCTCTAGTACCCAAAAGGTCACCCACCGGGT  2072

Query 1797  GCTGGGCCCCGTCAGAGAGCCCCGAAGCCAGGACAGGAGACGGCAGCAGCAGCCCCTGAACCATCGTCCTGCAG  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCTGGGCCCCGTCAGAGAGCCCCGAAGCCAGGACAGGAGACGGCAGCAGCAGCCCCTGAACCATCGTCCTGCAG  2146

Query 1871  GCAGCCTCGCTCCATCCCCAGCTCCTACTAGTTCTGGCCCAGCCTCCTCACACAAGCTGGGCTCCTGTCTACTG  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCAGCCTCGCTCCATCCCCAGCTCCTACTAGTTCTGGCCCAGCCTCCTCACACAAGCTGGGCTCCTGTCTACTG  2220

Query 1945  CCTGATTCATTCAACATACCAGGGAGCAGTTGCTCACTCTTGTCCTCTGGAGACAAACCAGAGGCTGTCATGGT  2018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCTGATTCATTCAACATACCAGGGAGCAGTTGCTCACTCTTGTCCTCTGGAGACAAACCAGAGGCTGTCATGGT  2294

Query 2019  AATCGGGAAAGGTCTGCTAGGGACTGGAGCTCGGATGCCCTGCATCAAGACTCGATTGCAGACCTGTCCGAGGA  2092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 2295  AATCGGGAAAGGTCTGCTAGGGACTGGAGCTCGGATGCCCTGCATCAAGACTCGATTG----------------  2352

Query 2093  GAGTTTCCGCCAGGAGGGGTCCCGGATTCCCCAGGCTAGGCCCAGGTTGGGCCGGGGCTCACCGCCGACTCGCA  2166
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353  -------------------------------CAGGCTAGGCCCAGGTTGGGCCGGGGCTCACCGCCGACTCGCA  2395

Query 2167  GAGGGA--------------------------------------------------------------------  2172
            ||||||                                                                    
Sbjct 2396  GAGGGATGAAAGGCTCTTCAGGCCCCACATCCCCTACCCCCCGGACCAGGGAGAGCAGTGAGCTGGAGCTGGGA  2469

Query 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172
                                                                                      
Sbjct 2470  TCCTGCTCTGCTACACCAGGGCTGCCTCAGGCCAGGCCCCCACGGCCCCGCTCTGCCCCTGCCTTTTCTCCTAT  2543

Query 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172
                                                                                      
Sbjct 2544  ATCCTGTAGTCTATCTGACTCCCCATCCTGGAATTGTTACAGCAGGGGTCCCTTGGGCCAACCTGAGGTTTGTT  2617

Query 2173  -----------------------------------------  2172
                                                     
Sbjct 2618  TTGTCCCTAAATCTCCCCCACTGACTGTTTCTCCCCGGGTC  2658