Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12497
• Subject: XM_017012545.1
• Aligned Length: 1217
• Identities: 999
• Gaps: 175

Alignment

Query    1  ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCA---TGGAAACATGGGTTCTT-GTGGCTACCAGCCTG-------------  57
            ||||..|.|||  ||   |||.|||   ||||.|.|||     || |||   |..||||||             
Sbjct    1  ATGGTCCCCAT--CA---TTTCCCAATGTGGAGATATG-----TTGGTG---AGAAGCCTGAGGCAGGAAGCAG  61

Query   58  -GTACTCCTCTATATTTATGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCT--GGGCCAACCCC  128
             |.||                 |.|.|.|| |||.|||||     |||    .||.|||.|  |||||.||.||
Sbjct   62  AGAAC-----------------AGCAAGTC-CATCAACTT-----GAA----AGATTTCTTTGGGGCCTACACC  108

Query  129  TCTGCCT----TTTCTGGGA-ACTATTT----TGTTCTACCTTAGGAGGTCTCTGAATAAGATTCCCAGCTGGG  193
             .||..|    |..||||.| |.|||||    ||    |.||| ||| .|||||.||.||   ||         
Sbjct  109  -ATGGATGTAATCACTGGCACATTATTTGGAGTG----AACTT-GGA-TTCTCTCAACAA---TC---------  163

Query  194  CGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCG  267
                    |.||.|      ||||     ||||      |||||              .||..|.|.||     
Sbjct  164  --------CACAAG------ATCC-----CTTT------CTGAA--------------AAATATGAAGA-----  193

Query  268  AGACCAGCTTTGCCAACATGGG--TCTTTGGA---ATTTTGACAGAGAAT-GTAATGAAAAATACGGAGAAATG  335
                 ||||||  .||.||.||  |.||||||   .||||.||      | .||||     ||           
Sbjct  194  -----AGCTTT--TAAAATTGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC------TCTTAAT-----AT-----------  238

Query  336  TGGGGCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCC  409
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  -----CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCC  307

Query  410  ATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTC  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  ATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTC  381

Query  484  TTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGT  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  TTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGT  455

Query  558  GGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAAC  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  GGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAAC  529

Query  632  TGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTC  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  TGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTC  603

Query  706  ACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGT  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  ACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGT  677

Query  780  TAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGA  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  TAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGA  751

Query  854  TGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAA---AGG  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
Sbjct  752  TGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAGTAGG  825

Query  925  TTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCAT  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  TTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCAT  899

Query  999  TGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTT  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  TGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTT  973

Query 1073  GTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAA  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  GTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAA  1047

Query 1147  GTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1179
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048  GTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1080