Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12570
- Subject:
- NM_001145928.1
- Aligned Length:
- 1083
- Identities:
- 686
- Gaps:
- 397
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MGPPRHPQAGEIEAGGAGGGRRLQVEMSSQQFPRLGAPSTGLSQAPSQIANSGSAGLINPAATVNDESGRDSEV 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 SAREHMSSSSSLQSREEKQEPVVVRPYPQVQMLSTHHAVASATPVAVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 MPSRPIAPAPPSTLSLPPKVPGQVTVTMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPP 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 LHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTVLRPTSQLPNAATAQPAVQHIIHQPIQSRPPVTTSNAIPPAVVATVSAT 296
Query 1 ------------------------------------------------------------------MAQKTIFS 8
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Sbjct 297 RAQSPVITTTAAHATDSALSRPTLSIQHPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFS 370
Query 9 TGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAGSVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPR 82
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Sbjct 371 TGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAGSVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPR 444
Query 83 IQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVAMETRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYP 156
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Sbjct 445 IQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVAMETRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYP 518
Query 157 VSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNPMQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIH 230
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Sbjct 519 VSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNPMQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIH 592
Query 231 SATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKTSAVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSP 304
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Sbjct 593 SATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKTSAVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSP 666
Query 305 RPSILRKKPATD-----------------------------------GAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQN 343
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Sbjct 667 RPSILRKKPATDGMAVRKTLIPPQPPDVASPRVESSMRSTSGSPRPAGAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQN 740
Query 344 NDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAASPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPV 417
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Sbjct 741 NDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAASPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPV 814
Query 418 PEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATNTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMET 491
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Sbjct 815 PEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATNTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMET 888
Query 492 NSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEYIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKK 565
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Sbjct 889 NSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEYIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKK 962
Query 566 AMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQR 639
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Sbjct 963 AMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQR 1036
Query 640 CKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLKLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 686
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Sbjct 1037 CKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLKLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 1083
