Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12570
• Subject: NM_001330299.2
• Aligned Length: 1056
• Identities: 686
• Gaps: 370

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSSQQFPRLGAPSTGLSQAPSQIANSGSAGLINPAATVNDESGRDSEVSAREHMSSSSSLQSREEKQEPVVVRP  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  YPQVQMLSTHHAVASATPVAVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPTMPSRPIAPAPPSTLSLPPKVPGQVTV  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPPLHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTV  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  LRPTSQLPNAATAQPAVQHIIHQPIQSRPPVTTSNAIPPAVVATVSATRAQSPVITTTAAHATDSALRPTLSIQ  296

Query    1  ---------------------------------------MAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAGS  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  HPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAGS  370

Query   36  VSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVAM  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  VSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVAM  444

Query  110  ETRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNPM  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ETRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNPM  518

Query  184  QLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKTS  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  QLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKTS  592

Query  258  AVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATD---------------  316
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  593  AVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATDGMAVRKTLIPPQPPD  666

Query  317  --------------------GAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAAS  370
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  VASPRVESSMRSTSGSPRPAGAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAAS  740

Query  371  PPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATN  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  PPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATN  814

Query  445  TVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEY  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEY  888

Query  519  IDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQ  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  IDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQ  962

Query  593  LLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLK  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLK  1036

Query  667  LLNKNGTVKKVSKLKRKEKV  686
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LLNKNGTVKKVSKLKRKEKV  1056