Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12570
Subject:
NM_001330300.2
Aligned Length:
1022
Identities:
685
Gaps:
337

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSSQQFPRLGAPSTGLSQAPSQIANSGSAGLINPAATVNDESGRDSEVSAREHMSSSSSLQSREEKQEPVVVRP  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  YPQVQMLSTHHAVASATPVAVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPTMPSRPIAPAPPSTLSLPPKVPGQVTV  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPPLHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTV  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  LRPTSQLPNAATAQPAVQHIIHQPIQSRPPVTTSNAIPPAVVATVSATRAQSPVITTTAAHATDSALSRPTLSI  296

Query    1  ----------------------------------------MAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAG  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  QHPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAG  370

Query   35  SVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVA  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  SVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVA  444

Query  109  METRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNP  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  METRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNP  518

Query  183  MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKT  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKT  592

Query  257  SAVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATDGAKPKSEIHVSMAT  330
            | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  S-VVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATDGAKPKSEIHVSMAT  665

Query  331  PVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAASPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVT  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  PVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAASPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVT  739

Query  405  VGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATNTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQ  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  VGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATNTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQ  813

Query  479  HVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEYIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHF  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  HVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEYIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHF  887

Query  553  QRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDL  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  QRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDL  961

Query  627  HRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLKLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  HRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLKLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV  1021