Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12570
- Subject:
- NM_001330302.2
- Aligned Length:
- 3171
- Identities:
- 2055
- Gaps:
- 1116
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTGCAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTCAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAGGCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCCCGCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACCATGC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTACCGTT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATCCCAG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCTCTTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCACAGTC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAACCAAT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACCAGAG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTCTATC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCACACT 962
Query 1 ----------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 28
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 1036
Query 29 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 1110
Query 103 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 1184
Query 177 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 1258
Query 251 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 1332
Query 325 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 1406
Query 399 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 1480
Query 473 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 1554
Query 547 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 1628
Query 621 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 1702
Query 695 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 1776
Query 769 TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 842
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 T---CAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 1847
Query 843 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 1921
Query 917 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGAT------------------------------------------ 948
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGAATGGCAGTTCGGAAAACCCTCATTCCTCCTCAGCCTCCT 1995
Query 949 ---------------------------------------------------------------GGTGCCAAACC 959
|||||||||||
Sbjct 1996 GATGTTGCTAGTCCTCGAGTGGAAAGCTCTATGCGGAGTACGTCTGGGTCACCTAGGCCTGCAGGTGCCAAACC 2069
Query 960 CAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATG 2143
Query 1034 ATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 ATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCC 2217
Query 1108 AGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCAC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 AGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCAC 2291
Query 1182 CATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTG 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 CATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTG 2365
Query 1256 AAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 AAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACC 2439
Query 1330 AACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 AACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGC 2513
Query 1404 CTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACA 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACA 2587
Query 1478 GCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 GCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAG 2661
Query 1552 TATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCG 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 TATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCG 2735
Query 1626 GAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 GAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTA 2809
Query 1700 TGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCC 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 TGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCC 2883
Query 1774 CAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCC 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 CAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCC 2957
Query 1848 AAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTA 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 AAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTA 3031
Query 1922 AACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTG 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032 AACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTG 3105
Query 1996 AAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 2058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3106 AAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 3168