Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12570
- Subject:
- NM_172965.2
- Aligned Length:
- 1057
- Identities:
- 646
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MSSQQFPRLGTPSPGLSQPPSQIASSGSAGLINQVATVNDEAGRDADVGTREHVGPSSSLPPREEKQEPVVVRP 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 YPQVQMLPAHHAVASATPVAVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPTMPSRPIAPAPPSTMSLPPKVPGQVTV 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPPLHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTV 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 LRPTSQLPNAATAQPAVQHLIHQPIQSRPPVTTSSTIPPAVVATVSATRAQSPVITTTAAHAADSTLSRPTLSI 296
Query 1 ----------------------------------------MAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAG 34
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Sbjct 297 QHPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTLPSTTTAG 370
Query 35 SVSHTQAPTSTIVTMTVPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRASPNPVA 108
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Sbjct 371 SVSHTQAPTSTIVTMTMPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPPERSSLIPISGHRASPNPVA 444
Query 109 METRSDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNP 182
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Sbjct 445 METRNDNRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSTITAQTGVGVASTVHLNP 518
Query 183 MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTPGIQPAPLGTQGIHSATPINTQGLQPAPMGTQQPQPEGKT 256
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Sbjct 519 MQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPAPIGTSGIQPAPIGTPGIHSAAPINTQGLQPAAMANQQPQPEGKT 592
Query 257 SAVVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATD-------------- 316
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Sbjct 593 S-VVLADGATIVANPISNPFSAAPAATTVVQTHSQSASTNTPAQGSSPRPSILRKKPATDGMAVRKTLLPPQPP 665
Query 317 ---------------------GAKPKSEIHVSMATPVTVSMETVSNQNNDQPTIAVPPTAQQPPPTIPTMIAAA 369
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Sbjct 666 DVATPRVESSMRSASGSPRPAGAKPKSEVHVSIATPVTVSLETISNQNAEQPTVAVPPTAQQPPPTIPSMIAAA 739
Query 370 SPPSQPAVALSTIPGAVPITPPITTIAAAPPPSVTVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLAT 443
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Sbjct 740 SPPSQPAIALSTIPGAVPVTPPITTIAATPTLSAPVGGTPSTVLGPPVPEIKVKEEAEPVDITRPVSTVPPLAT 813
Query 444 NTVSPSLALLANNLSMPTSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKE 517
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Sbjct 814 NTVSPSLALLASNLSMPPSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSAAKSLLVKAEKRKSPPKE 887
Query 518 YIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAA 591
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Sbjct 888 YIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAA 961
Query 592 QLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVL 665
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Sbjct 962 QLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVL 1035
Query 666 KLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 686
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Sbjct 1036 KLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV 1056