Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12570
- Subject:
- XM_005263767.3
- Aligned Length:
- 3246
- Identities:
- 2058
- Gaps:
- 1188
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCCCTCCGCGGCACCCCCAGGCCGGCGAGATAGAAGCGGGCGGTGCGGGCGGCGGGCGGCGGCTACAGGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAAATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAAACAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AGTGCCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GCCCTATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CGCCAGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ATGCCTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTAC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CGTTACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CCAGTAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTTCACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCAC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 AGTCCTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAAC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CAATCCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AGAGCTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGGCCAACCTTGTCTAT 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 CCAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCACAC 1036
Query 1 -----------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACT 27
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACT 1110
Query 28 GGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGG 101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGG 1184
Query 102 ATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTA 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTA 1258
Query 176 CTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATC 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATC 1332
Query 250 CAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGC 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGC 1406
Query 324 CATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTT 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTT 1480
Query 398 CTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTT 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTT 1554
Query 472 TCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCC 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCC 1628
Query 546 CATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCC 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCC 1702
Query 620 AGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCA 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCA 1776
Query 694 GCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGAC 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGAC 1850
Query 768 TTCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAG 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAG 1924
Query 842 CAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGG 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGG 1998
Query 916 CCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGAT----------------------------------------- 948
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGAATGGCAGTTCGGAAAACCCTCATTCCTCCTCAGCCTCC 2072
Query 949 ----------------------------------------------------------------GGTGCCAAAC 958
||||||||||
Sbjct 2073 TGATGTTGCTAGTCCTCGAGTGGAAAGCTCTATGCGGAGTACGTCTGGGTCACCTAGGCCTGCAGGTGCCAAAC 2146
Query 959 CCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAAT 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAAT 2220
Query 1033 GATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGC 2294
Query 1107 CAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCA 2368
Query 1181 CCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCT 2442
Query 1255 GAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTAC 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTAC 2516
Query 1329 CAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTG 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTG 2590
Query 1403 CCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAAC 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAAC 2664
Query 1477 AGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGA 2738
Query 1551 GTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATC 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATC 2812
Query 1625 GGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCT 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCT 2886
Query 1699 ATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGC 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGC 2960
Query 1773 CCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCC 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCC 3034
Query 1847 CAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGT 3108
Query 1921 AAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCT 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCT 3182
Query 1995 GAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 3246
