Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12570
- Subject:
- XM_005263769.3
- Aligned Length:
- 3171
- Identities:
- 2058
- Gaps:
- 1113
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTGCAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTCAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAGGCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCCCGCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACCATGC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTACCGTT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATCCCAG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCTCTTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCACAGTC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAACCAAT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACCAGAG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTCTATC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCACACT 962
Query 1 ----------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 28
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG 1036
Query 29 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA 1110
Query 103 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC 1184
Query 177 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC 1258
Query 251 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC 1332
Query 325 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC 1406
Query 399 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT 1480
Query 473 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC 1554
Query 547 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA 1628
Query 621 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG 1702
Query 695 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT 1776
Query 769 TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC 1850
Query 843 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC 1924
Query 917 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGAT------------------------------------------ 948
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGAATGGCAGTTCGGAAAACCCTCATTCCTCCTCAGCCTCCT 1998
Query 949 ---------------------------------------------------------------GGTGCCAAACC 959
|||||||||||
Sbjct 1999 GATGTTGCTAGTCCTCGAGTGGAAAGCTCTATGCGGAGTACGTCTGGGTCACCTAGGCCTGCAGGTGCCAAACC 2072
Query 960 CAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATG 2146
Query 1034 ATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCC 2220
Query 1108 AGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCAC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCAC 2294
Query 1182 CATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTG 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTG 2368
Query 1256 AAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACC 2442
Query 1330 AACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGC 2516
Query 1404 CTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACA 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACA 2590
Query 1478 GCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAG 2664
Query 1552 TATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCG 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCG 2738
Query 1626 GAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTA 2812
Query 1700 TGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCC 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCC 2886
Query 1774 CAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCC 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCC 2960
Query 1848 AAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTA 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTA 3034
Query 1922 AACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTG 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTG 3108
Query 1996 AAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 2058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC 3171