Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12570
• Subject: XM_006712749.3
• Aligned Length: 3144
• Identities: 2055
• Gaps: 1089

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCCTCCGCGGCACCCCCAGGCCGGCGAGATAGAAGCGGGCGGTGCGGGCGGCGGGCGGCGGCTACAGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAAATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAAACAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AGTGCCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCCCTATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CGCCAGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  ATGCCTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTAC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CGTTACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATC  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  CCAGTAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCT  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  CTTCACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCAC  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  AGTCCTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAAC  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  CAATCCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACC  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  AGAGCTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTC  962

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  963  TATCCAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCA  1036

Query    1  --------------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGT  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGT  1110

Query   25  ACTGGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGC  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGC  1184

Query   99  TGGATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATG  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATG  1258

Query  173  CTACTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTACTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGG  1332

Query  247  ATCCAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGT  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGT  1406

Query  321  GGCCATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCC  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCC  1480

Query  395  CTTCTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCA  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTCTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCA  1554

Query  469  GTTTCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAA  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTTCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAA  1628

Query  543  CCCCATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTA  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTA  1702

Query  617  CCCAGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCAC  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCAGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCAC  1776

Query  691  TCAGCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAA  1850

Query  765  GACTTCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTC  838
            |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACTT---CAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTC  1921

Query  839  CAGCAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCA  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  CAGCAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCA  1995

Query  913  CGGCCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGC  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CGGCCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGC  2069

Query  987  CACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAA  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAA  2143

Query 1061  CTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCC  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  CTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCC  2217

Query 1135  CTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGT  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  CTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGT  2291

Query 1209  CACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAAC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  CACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAAC  2365

Query 1283  CAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTG  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  CAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTG  2439

Query 1357  CTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCA  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  CTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCA  2513

Query 1431  ACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCA  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  ACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCA  2587

Query 1505  AGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATAT  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  AGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATAT  2661

Query 1579  GTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCA  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  GTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCA  2735

Query 1653  CTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAG  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  CTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAG  2809

Query 1727  GAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAA  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810  GAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAA  2883

Query 1801  CATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGA  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884  CATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGA  2957

Query 1875  TCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAG  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958  TCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAG  3031

Query 1949  CCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTC  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032  CCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTC  3105

Query 2023  AAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3106  AAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  3141