Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12575
- Subject:
- NM_001330498.2
- Aligned Length:
- 1329
- Identities:
- 921
- Gaps:
- 402
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTAGTTCCTTTCCAGTGGTTTTGCTGGAAACCATGTCTCATTATACAGATGAACCCAGATTTACCATAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCAGATAGATCTGCTTCAGCGACTTCGGCGTACTGGAATGACTAAACATGAAATTCTCCATGCCTTGGAAACTT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGACCGTCTTGATCAAGAGCATAGTGACAAGTTTGGAAGAAGGTCCAGCTATGGAGGAAGTTCATATGGGAAT 222
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGTCCCC 8
||||||||
Sbjct 223 AGTACTAACAATGTCCCAGCATCTTCCTCTACAGCTACAGCTTCCACACAGACGCAGCATTCGGGAATGTCCCC 296
Query 9 GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCACCTAGCAACAGTTATGATACTTCCCCACAGCCTTGCACTACCAATCAAAATGGGAGGGAGAATAATGAGC 370
Query 83 GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATTATCTACATCCAATGGAAAGATGTCACCAACTCGCTACCATGCAAACAGCATGGGTCAGAGGTCATACAGT 444
Query 157 TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGAAGCCTCAGAAGAGGACCTAGATGTAGATGATAAAGTGGAAGAATTAATGAGGAGGGACAGCAGTGTGAT 518
Query 231 AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAGAGGAAATCAAAGCCTTTCTTGCCAATCGGAGGATTTCCCAAGCAGTTGTTGCACAGGTAACAGGTATCA 592
Query 305 GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCAGAGCCGGATCTCTCATTGGCTGTTGCAGCAGGGATCAGACCTGAGTGAACAGAAGAAAAGAGCATTTTAC 666
Query 379 CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGATGGTATCAACTTGAGAAGACAAACCCTGGCGCTACACTAAGTATGAGACCAGCCCCCATTCCAATAGAGGA 740
Query 453 CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTGAATGGAGACAAACGCCTCCCCCAGTCTCTGCCACATCTGGTACTTTCCGACTGCGACGAGGGAGTCGAT 814
Query 527 TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTACCTGGAGAAAGGAGTGCCTGGCTGTTATGGAAAGTTACTTCAATGAGAATCAATACCCAGATGAAGCAAAG 888
Query 601 AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGGAAGAAATTGCAAACGCTTGCAATGCAGTTATACAGAAGCCAGGCAAAAAGCTGTCAGATCTGGAAAGAGT 962
Query 675 TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATTGCAGCAA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TACCTCCCTGAAAGTATATAATTGGTTTGCTAACAGAAGGAAGGAGATCAAGAGGAGAGCCAATATTGCAGCAA 1036
Query 749 TCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAATGAC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCTGGAGAGTCATGGGATAGATGTGCAGAGTCCAGGAGGCCACTCAAACAGTGATGATGTCGACGGGAATGAC 1110
Query 823 TACTCTGAGCAGGATACTTGGCAAGTACGCAATGGGGAGGAGGAGGAGGGAAGAAGTTCAGAGGGAGGCAGAGA 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACTCTGAGCAGGATACTTGGCAAGTACGCAATGGGGAGGAGGAGGAGGGAAGAAGTTCAGAGGGAGGCAGAGA 1184
Query 897 AGCAGAGAAGGTAGA-AG-AAGAG-CGGAG-GATC--------------------------------------- 927
|||||||||||..|| || |.||| |..|| ||.|
Sbjct 1185 AGCAGAGAAGGATGACAGTACGAGCCATAGTGACCACCAAGACCCCATCTCATTAGCTGTGGAAATGGCAGCAG 1258
Query 928 ----------------------------------------------------------------------- 927
Sbjct 1259 TCAACCACACTATCTTGGCATTGGCCCGACAAGGAGCCAACGAAATCAAGACAGAGGCCCTGGATGATGAC 1329