Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12583
- Subject:
- XM_011525249.2
- Aligned Length:
- 2481
- Identities:
- 1857
- Gaps:
- 624
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCTCTGCTGACAAGAATGGCGGGAGCGTGTCCTCTGTGTCCAGCAGCCGCCTGCAGAGCCGGAAGCCACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAACCTCTCCATCACCATCCCGCCACCCGAGAAAGAGACCCAGGCCCCTGGCGAGCAGGACAGCATGCTGCCTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGAGGAAGAACCCAGCCTACTTGAAGAGCGTCAGCCTCCAGGAGCCACGCAGCCGATGGCAGGAGAGTTCAGAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGCGCCCTGGCTTCCGCCGCCAGGCCTCACTGTCCCAGAGCATCCGCAAGGGCGCAGCCCAGTGGTTTGGAGT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CAGCGGCGACTGGGAGGGGCAGCGGCAGCAGTGGCAGCGCCGCAGCCTGCACCACTGCAGCATGCGCTACGGCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GCCTGAAGGCCTCGTGCCAGCGTGACCTGGAGCTCCCCAGCCAGGAGGCACCGTCCTTCCAGGGCACTGAGTCC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CCAAAGCCCTGCAAGATGCCCAAGATTGTGGATCCGCTGGCCCGGGGCCGGGCCTTCCGCCACCCGGAGGAGAT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GGACAGGCCCCACGCCCCGCACCCACCGCTGACCCCCGGAGTCCTGTCCCTCACCTCCTTCACCAGTGTCCGTT 592
Query 1 --------------------------------ATGTCTGTGGCCCACATGAGCTTGCAAGCTGCCGCTGCCCTC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGGCTACTCCCACCTGCCACGCCGCAAGAGAATGTCTGTGGCCCACATGAGCTTGCAAGCTGCCGCTGCCCTC 666
Query 43 CTCAAGGGGCGCTCGGTGCTGGATGCCACCGGACAGCGGTGCCGGGTGGTCAAGCGCAGCTTTGCCTTCCCGAG 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCAAGGGGCGCTCGGTGCTGGATGCCACCGGACAGCGGTGCCGGGTGGTCAAGCGCAGCTTTGCCTTCCCGAG 740
Query 117 CTTCCTGGAGGAGGATGTGGTCGATGGGGCAGACACGTTTGACTCCTCCTTTTTTAGTAAGGAAGAAATGAGCT 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTCCTGGAGGAGGATGTGGTCGATGGGGCAGACACGTTTGACTCCTCCTTTTTTAGTAAGGAAGAAATGAGCT 814
Query 191 CCATGCCTGATGATGTCTTTGAGTCCCCCCCACTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGGATCCCACACTCAGCCTCC 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCATGCCTGATGATGTCTTTGAGTCCCCCCCACTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGGATCCCACACTCAGCCTCC 888
Query 265 CCTGTCTCCCCCGATGGGGTGCAAATCCCTCTGAAGGAGTATGGCCGAGCCCCAGTCCCCGGGCCCCGGCGCGG 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGTCTCCCCCGATGGGGTGCAAATCCCTCTGAAGGAGTATGGCCGAGCCCCAGTCCCCGGGCCCCGGCGCGG 962
Query 339 CAAGCGCATCGCCTCCAAGGTGAAGCACTTTGCCTTTGATCGGAAGAAGCGGCACTACGGCCTCGGCGTGGTGG 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGCGCATCGCCTCCAAGGTGAAGCACTTTGCCTTTGATCGGAAGAAGCGGCACTACGGCCTCGGCGTGGTGG 1036
Query 413 GCAACTGGCTGAACCGCAGCTACCGCCGCAGCATCAGCAGCACTGTGCAGCGGCAGCTGGAGAGCTTCGACAGC 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAACTGGCTGAACCGCAGCTACCGCCGCAGCATCAGCAGCACTGTGCAGCGGCAGCTGGAGAGCTTCGACAGC 1110
Query 487 CACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCTGACCTTCGTCCATGTCATCATCACGCTGCTGGTGATTTGCACGTATGG 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCTGACCTTCGTCCATGTCATCATCACGCTGCTGGTGATTTGCACGTATGG 1184
Query 561 CATCGCACCCGTGGGCTTTGCCCAGCACGTCACCACCCAGCTGGTGCTGCGGAACAAAGGTGTGTACGAGAGCG 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATCGCACCCGTGGGCTTTGCCCAGCACGTCACCACCCAGCTGGTGCTGCGGAACAAAGGTGTGTACGAGAGCG 1258
Query 635 TGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTCTGGGTTGGCCCCAGCTCGATTGACCTGATCCACCTGGGGGCCAAGTTC 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTCTGGGTTGGCCCCAGCTCGATTGACCTGATCCACCTGGGGGCCAAGTTC 1332
Query 709 TCACCCTGCATCCGGAAGGACGGGCAGATCGAGCAGCTGGTGCTGCGCGAGCGAGACCTGGAGCGGGACTCAGG 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCACCCTGCATCCGGAAGGACGGGCAGATCGAGCAGCTGGTGCTGCGCGAGCGAGACCTGGAGCGGGACTCAGG 1406
Query 783 CTGCTGTGTCCAGAATGACCACTCCGGATGCATCCAGACCCAGCGGAAGGACTGCTCGGAGACTTTGGCCACTT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGCTGTGTCCAGAATGACCACTCCGGATGCATCCAGACCCAGCGGAAGGACTGCTCGGAGACTTTGGCCACTT 1480
Query 857 TTGTCAAGTGGCAGGATGACACTGGGCCCCCCATGGACAAGTCTGATCTGGGCCAGAAGCGGACTTCGGGGGCT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTGTCAAGTGGCAGGATGACACTGGGCCCCCCATGGACAAGTCTGATCTGGGCCAGAAGCGGACTTCGGGGGCT 1554
Query 931 GTCTGCCACCAGGACCCCAGGACCTGCGAGGAGCCAGCCTCCAGCGGTGCCCACATCTGGCCCGATGACATCAC 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTCTGCCACCAGGACCCCAGGACCTGCGAGGAGCCAGCCTCCAGCGGTGCCCACATCTGGCCCGATGACATCAC 1628
Query 1005 TAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGGCCAGGAGCAACCACACAGGCTTCCTGCACATGGACTGCGAGATCAAGG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGGCCAGGAGCAACCACACAGGCTTCCTGCACATGGACTGCGAGATCAAGG 1702
Query 1079 GCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAAGGGCAGCTGTGAGATCACCACCCGGGAATACTGTGAGTTCATGCACGGC 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAAGGGCAGCTGTGAGATCACCACCCGGGAATACTGTGAGTTCATGCACGGC 1776
Query 1153 TATTTCCATGAGGAAGCAACACTCTGCTCCCAGGTGCACTGCTTGGACAAGGTGTGTGGGCTGCTGCCCTTCCT 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TATTTCCATGAGGAAGCAACACTCTGCTCCCAGGTGCACTGCTTGGACAAGGTGTGTGGGCTGCTGCCCTTCCT 1850
Query 1227 CAACCCTGAGGTCCCAGATCAGTTCTACAGGCTCTGGCTGTCTCTCTTCCTACATGCTGGCGTGGTGCACTGCC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAACCCTGAGGTCCCAGATCAGTTCTACAGGCTCTGGCTGTCTCTCTTCCTACATGCTGGCGTGGTGCACTGCC 1924
Query 1301 TCGTGTCTGTGGTCTTTCAAATGACCATCCTGAGGGACCTGGAGAAGCTGGCCGGCTGGCACCGTATCGCCATC 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCGTGTCTGTGGTCTTTCAAATGACCATCCTGAGGGACCTGGAGAAGCTGGCCGGCTGGCACCGTATCGCCATC 1998
Query 1375 ATCTTCATCCTCAGTGGCATCACAGGCAACCTCGCCAGTGCCATCTTTCTCCCATACCGGGCAGAGGTGGGCCC 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATCTTCATCCTCAGTGGCATCACAGGCAACCTCGCCAGTGCCATCTTTCTCCCATACCGGGCAGAGGTGGGCCC 2072
Query 1449 GGCCGGCTCACAGTTCGGCCTCCTCGCCTGCCTCTTCGTGGAGCTCTTCCAGAGCTGGCCGCTGCTGGAGAGGC 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGCCGGCTCACAGTTCGGCCTCCTCGCCTGCCTCTTCGTGGAGCTCTTCCAGAGCTGGCCGCTGCTGGAGAGGC 2146
Query 1523 CCTGGAAGGCCTTCCTCAACCTCTCGGCCATCGTGCTCTTCCTGTTCATCTGTGGCCTCCTGCCCTGGATCGAC 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCTGGAAGGCCTTCCTCAACCTCTCGGCCATCGTGCTCTTCCTGTTCATCTGTGGCCTCCTGCCCTGGATCGAC 2220
Query 1597 AACATCGCCCACATCTTCGGCTTCCTCAGTGGCCTGCTGCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCCTACATCACCTTCGG 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AACATCGCCCACATCTTCGGCTTCCTCAGTGGCCTGCTGCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCCTACATCACCTTCGG 2294
Query 1671 CACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGGGCACTCATCCTGGTGTCACTGCTGGCCTTTGCCGGCCTCTTCGCCGCCC 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGGGCACTCATCCTGGTGTCACTGCTGGCCTTTGCCGGCCTCTTCGCCGCCC 2368
Query 1745 TCGTGCTGTGGCTGTACATCTACCCCATTAACTGGCCCTGGATCGAGCACCTCACCTGCTTCCCCTTCACCAGC 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCGTGCTGTGGCTGTACATCTACCCCATTAACTGGCCCTGGATCGAGCACCTCACCTGCTTCCCCTTCACCAGC 2442
Query 1819 CGCTTCTGCGAGAAGTATGAGCTGGACCAGGTGCTGCAC 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CGCTTCTGCGAGAAGTATGAGCTGGACCAGGTGCTGCAC 2481