Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12639
• Subject: XM_017022584.1
• Aligned Length: 2036
• Identities: 1459
• Gaps: 574

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTGTCAGCTACCTGATATTAACATTGCTCCACGTTCAAACAGCAGTGTTAGCAAGACCTGGGGGAGAGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGCTTCAAAGTCACATTTCCACAGGAATTGATATGGAAAGGCATGAACAGAGCATTGGCTGTGATGACTACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAGGCTCCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTGTTTAAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAA  296

Query    1  ----------ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGA  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCACGGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGA  370

Query   65  ACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATT  138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATT  444

Query  139  TCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCA  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCA  518

Query  213  GCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCC  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCC  592

Query  287  ACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAA  666

Query  361  GGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTT  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTT  740

Query  435  CCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCAC  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCAC  814

Query  509  GGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAG  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAG  888

Query  583  TACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAA  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAA  962

Query  657  GCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGT  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGT  1036

Query  731  GCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTG  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTG  1110

Query  805  ACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAG  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAG  1184

Query  879  CGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGA  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGA  1258

Query  953  AGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAG  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAG  1332

Query 1027  AACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGG  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGG  1406

Query 1101  GGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGA  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGA  1480

Query 1175  ACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGC  1554

Query 1249  TGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGA  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGA  1628

Query 1323  CACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCA  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCA  1702

Query 1397  AGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG------  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|.||||||  ||    |||||      
Sbjct 1703  AGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCT  1768

Query 1465  -------CC---AAGT----------------------------------------------------------  1470
                   ||   ||||                                                          
Sbjct 1769  TTCGGGTCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCA  1842

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1843  GAAGAGAGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAA  1916

Query 1471  --------------------------------------------------------------------------  1470
                                                                                      
Sbjct 1917  CTGCAACGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCC  1990

Query 1471  --------------------------------------  1470
                                                  
Sbjct 1991  GTGTGGCCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA  2028