Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12651
- Subject:
- NM_001193334.1
- Aligned Length:
- 1372
- Identities:
- 1288
- Gaps:
- 71
Alignment
Query 1 ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATT--------CAT--GCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTG--------- 55
|||| ||.|| .||||| ||| || |.|..|.|||||..|||||
Sbjct 1 ATGG---------CTGGG--GCAATTATAGAAAACATGAGC-----ACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGA 58
Query 56 -CCT--TCAAGCTAAACAACCAAATCA---------------------------GAGAAAATGCAGAAGTCTCC 99
.|| ||..|.| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TTCTGCTCGTGTT------CCAAATCATCGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGGAGAAAATGCAGAAGTCTCC 126
Query 100 ATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACG 173
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 ATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCGTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACG 200
Query 174 GAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTC 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTC 274
Query 248 CTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAG 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 CTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAG 348
Query 322 AAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAA 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAA 422
Query 396 GGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCA 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 GGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCA 496
Query 470 CCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAAT 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAAT 570
Query 544 ATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCAT 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 ATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCAT 644
Query 618 CTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACC 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACC 718
Query 692 ACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGT 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 ACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGT 792
Query 766 GAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGC 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 GAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGC 866
Query 840 CTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTC 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTC 940
Query 914 GGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATT 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATT 1014
Query 988 TTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCA 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 TTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCA 1088
Query 1062 GGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATG 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATG 1162
Query 1136 GGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAG 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 GGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAG 1236
Query 1210 TCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTCACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACC 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 TCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTCACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACC 1310
Query 1284 CACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG 1350