Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12652
• Subject: XM_024446941.1
• Aligned Length: 2571
• Identities: 1676
• Gaps: 888

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCCAGTTAGGTTTACATCAAAAGGCAAACAGATTACCAGAAATACAGCAGCCACTTTGCAGAAAGGAAGG  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct   75  ATTATGTCAAATAGTTAGAAGATTCCCAGAACTGCAACTTCCAGTGAGTCCCTCTGTGTGTCTGGATCAGGGAA  148

Query    2  TGCAATTAAAGCCGAGTACTTCGAGTCACCTTTTAAAAACAGTGAAGCCACGTGTGTGGAAACCAGGGGACTGG  75
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCAATTAAAGCCGAGTACTTCGAGTCACCTTTTAAAAACAGTGAAGCCACGTGTGTGGAAACCAGGGGACTGG  222

Query   76  AGTCGTGAACAGCTGAATGAAACGACAGTCCTTGCTCCACATGAAACAATCTTTCGAGCCGAAGATCTATCTGT  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCGTGAACAGCTGAATGAAACGACAGTCCTTGCTCCACATGAAACAATCTTTCGAGCCGAAGATCTATCTGT  296

Query  150  GATTCTTAAAGCGTATGTGTTGGTGACGTCCTTAACCCCTTTGCGTGCATTCATTCATTCGACTGGCACAGTTT  223
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GATTCTTAAAGCGTATGTGTTGGTGACGTCCTTAACCCCTTTGCGTGCATTCATTCATTCGACGGGCACAGTTT  370

Query  224  GGAATCCACCAAAGAAAAAACGCTTCACTGTCAAGCTGCAAACATTTTTTGAGACATTCCTGAGAGCCAGTTCA  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAATCCACCAAAGAAAAAACGCTTCACTGTCAAGCTGCAAACATTTTTTGAGACATTCCTGAGAGCCAGTTCA  444

Query  298  CCTCAACAGGCTTTTGACATTATGAAGGAAGCAATTGGCAAACTACTGCTAGCCGCTGAAGTATTCAGTGAAAC  371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCAACAGGCTTTTGACATTATGAAGGAAGCAATTGGCAAACTACTGCTAGCGGCTGAAGTATTCAGTGAAAC  518

Query  372  ATCTACTCTGGGACCAAAGACCTTCCATAGATGCAGATTCTGCTTTCAACTTCTAACTTTTGATATTGGTTATG  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCTACTCTGGGACCAAAGACCTTCCATAGATGCAGATTCTGCTTTCAACTTCTAACTTTTGATATTGGTTATG  592

Query  446  GCAGTTTCATGTACCCTGTAGTGCTCCAGGTACACGAGCATTTAAATTTTCAAGATTATGATAATATGGATTTT  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAGTTTCATGTACCCTGTAGTGCTCCAGGTACACGAGCATTTAAATTTTCAAGATTATGATAATATGGATTTT  666

Query  520  GAGGACCAAAATACAGAAGAATTCCTTTTAAATGACACTTTCAATTTTCTCTTCCCTAATGAATCATCACTTTC  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGACCAAAATACAGAAGAATTCCTTTTAAATGACACTTTCAATTTTCTCTTCCCTAATGAATCATCACTTTC  740

Query  594  CATATTTTCTGAGATATTTCAGAGACTTTATAGATCAGATGTTTTCAAGGGTGAAAACTATCAAAAGGAACTAA  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATATTTTCTGAGATATTTCAGAGACTTTATAGATCAGATGTTTTCAAGGGTGAAAACTATCAAAAGGAACTAA  814

Query  668  ATCAGTGTCTGTCCTTAGAAGAAATTAACTCAATTATGACTTTCATAAAGGAACTTGGAAGTCTGGGACAATTC  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAGTGTCTGTCCTTAGAAGAAATTAACTCAATTATGACTTTCATAAAGGAACTTGGAAGTCTGGGACAATTC  888

Query  742  CAACTGCTCTTCCCATCTACTACTCCTGGGATTCAGTCACTGATGCATGAATTTTATGATGTGGCAAATCCTGT  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAACTGCTCTTCCCATCTACTACTCCTGGGATTCAGTCACTGATGCATGAATTTTATGATGTGGCAAATCCTGT  962

Query  816  GGGAAATCCTGGCTCAGTCCTGACCCAATACTGGTCTCTTTTAAATGTATTTGAACAATTTCAGTTCATGAATA  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGAAATCCTGGCTCAGTCCTGACCCAATACTGGTCTCTTTTAAATGTATTTGAACAATTTCAGTTCATGAATA  1036

Query  890  AAAAGACACAGCCACATCCACTGGAATGGAATTCTTTCACAGAAGATAAGAACATTGAAAAACCACAAGTGCCA  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAAGACACAGCCACATCCACTGGAATGGAATTCTTTCACAGAAGATAAGAACATTGAAAAACCACAAGTGCCA  1110

Query  964  TTTGATGCAATAGAAAATAAAAAAGCTGGAGTTCCACAAATTAAAAATGAAAATAAAGAAATACATTGCAGTGA  1037
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTGATGCAATAGAAAATAAAAAAGCTGCAGTTCCACAAATTAAAAATGAAAATAAAGAAATACATTGCAGTGA  1184

Query 1038  TGATGAAAACACACCATGTCATATCAAGCAGATCTTCACACATCCACATTTGGAACTAAATCCTGACTTTCATC  1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATGAAAACACACCATGTCATATCAAGCAGATCTTCACACATCCACATTTGGAACTAAATCCTGACTTTCATC  1258

Query 1112  CAAAGATCAAAGATTATTACTGTGAAGTCCCATTTGATGTGGTAACAGTGACAATTGGAGTGGAAACTCCTAAG  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAAAGATCAAAGATTATTACTGTGAAGTCCCATTTGATGTGGTAACAGTGACAATTGGAGTGGAAACTCCTAAG  1332

Query 1186  TGTCTGTGCAAGGTGCACCTGTACGAGCAGGCAGGGCCAAGCTTTGCCAGCTACCCTCTGGGCTTAGGAATGAA  1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTCTGTGCAAGGTGCACCTGTACGAGCAGGCAGGGCCAAGCTTTGCCAGCTACCCTCTGGGCTTAGGAATGAA  1406

Query 1260  CAAAATCTCAATATTTGTTGTGGATGAATCTCCAGCACACGGTGAGACTCTGATCACGTACAAACTCACCATCT  1333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAAATCTCAATATTTGTTGTGGATGAATCTCCAGCACACGGTGAGACTCTGATCACGTACAAACTCACCATCT  1480

Query 1334  ATAGAGAAGACCGCCCAAGTCTGCCCTTGTTTGAGGCCTTCACAGCATGTGGTTTTGTGCAGGATTGTGGTTTG  1407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAGAGAAGACCGCCCAAGTCTGCCCTTGTTTGAGGCCTTCACAGCATGTGGTTTTGTGCAGGATTGTGGTTTG  1554

Query 1408  CTGATTCATCCAGAGGAAACCTGTGGGTTACAGCCTATTTCTTCTGACTACATTGAAGCCATTTTACAGTCTGA  1481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGATTCATCCAGAGGAAACCTGTGGGTTACAGCCTATTTCTTCTGACTACATTGAAGCCATTTTACAGTCTGA  1628

Query 1482  ACTAAAAAGATGTCCATCTGGGGACATGAAAGGCCAGTGGATTGTGCCTTGCCTTAGTTGTTCGGACAACAGGA  1555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACTAAAAAGATGTCCATCTGGGGACATGAAAGGCCAGTGGATTGTGCCTTGCCTTAGTTGTTCGGACAACAGGA  1702

Query 1556  CGTGTGACTGGAGAGAAATAACCTGGCAGCCCCACAACTGCCAATATGGTGTCCTAACTAAGCCTCAACTCCAG  1629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGTGTGACTGGAGAGAAATAACCTGGCAGCCCCACAACTGCCAATATGGTGTCCTAACTAAGCCTCAACTCCAG  1776

Query 1630  CAGTGCCTGGGAGGAAGGAAG----------TTGGGTGTCGATGTC------CAGAGAGTTC-----CTA----  1678
            |||||||||||||||||||||          ||||    .||| ||      |||||.|.||     |||    
Sbjct 1777  CAGTGCCTGGGAGGAAGGAAGATTCTGTTCATTGG----AGAT-TCAACCAACAGAGGGATCATGTACTATCTT  1845

Query 1679  ---GAA--GCCGTAAT----------------------------------------------------------  1689
               |||  ||.| |||                                                          
Sbjct 1846  ATTGAAAGGCTG-AATGAAACGTTGCAGGAATGGCAGAAAGTACATGGCACTAAATTCTATCACAACGTCAATG  1918

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 1919  GTGGGAAGACTTTGATCAGTTATTCCTACTATCCCCAGTTCTGGATAAGCCCTTCATTGAGACCAACATTTGAA  1992

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 1993  AATGCACTTGAACACCTCTTGCAAAGATCACGTCCCCTAGAGAATACTGGCCAGACTGTATTGGTTGTTGGTGG  2066

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2067  TGTTCAGTGGCTTAATTCCAATCACCTGCAAATTATTCACAAAGTTTTGAAGAGGGAAAATTTACTCAATATCC  2140

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2141  TAGTGATCATCAAAACTTTGGGAATTGGATTTCATCTGCCAGTGGATGGAGTACATTTCTTAACACAGAGTGAA  2214

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2215  GTACAGAACTTATGGAAAGAAAATTTGATTATTCTGGATACTGCAAAAAAACATGGCTATGAAGTAGTTGACAC  2288

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2289  ATTCACTATAACAATGGGGCGTTACAAAGAGTTTCTACAGGGGAAGTGTGGATGTCATTTCCATGAGGTAGTGA  2362

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2363  AATCAAAGTTATCCAAAGAATATAACTTTATTAAAATGAAAAGATCAAGAAATCATATCATGGGAAGATATTTC  2436

Query 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689
                                                                                      
Sbjct 2437  AGCAATCAAAGCAAACTACAACAAGGCACTGTAACAAATTTTCGATCGCCATATCATGTCAGAGGTCCAATAAA  2510

Query 1690  -------------------------------------------------------  1689
                                                                   
Sbjct 2511  TCAGGTTTGTTCTGAAATCCTTCTCAGCAGGATGTGTGCAAATAAAAGGACTATG  2565