Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12690
- Subject:
- XM_006521308.3
- Aligned Length:
- 1132
- Identities:
- 859
- Gaps:
- 146
Alignment
Query 1 ATGGACGGGGAGGAGCAGCAGCCACCGCACGAGGCCAACGTGGAACCTGTTGT--------------------- 53
|||||.||.|||| ||.|||||.|.||.|||||..|||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAGGGAGAGG---AGAAGCCAGCTCAAGAGGCTGACGTGGAACCTGTGGTAACAGCAGGCACCTCAGAAGC 71
Query 54 -----------------------GCCGTCAGA-----------------GGCTTCA------------------ 69
.||.||||| |.|||||
Sbjct 72 AGTGCCAAGGGTGCTTGCTGGAGACCCTCAGAACATCTCTGATGTGGATGCCTTCAACTTGCTCCTGGAGATGA 145
Query 70 -----------------------------------------------GAGCCGGTGCC------------CAGG 84
.|||..|||.| ||||
Sbjct 146 AACTGAAACGACGGCGTGAACGCCCCAACCTTCCACGTACAGTGACCCAGCTAGTGGCCGAGGATGGGAGCAGG 219
Query 85 GTGTACGTGGTGGGGACAGCCCACTTCAGCGACGACAGCAAGAGGGACGTTGTGAAGACCATCCGGGAGGTGCA 158
|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 220 GTGTATGTGGTGGGCACTGCTCACTTCAGTGATGATAGCAAGAGAGATGTAGTAAAGACTATCCGGGAGGTGCA 293
Query 159 GCCTGACGTGGTGGTCGTGGAGCTCTGCCAATATCGTGTGTCCATGCTGAAGATGGACGAGAGCACGCTGCTGC 232
.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 294 ACCGGATGTGGTCGTGGTGGAGCTCTGTCAGTACCGGGTGTCCATGCTCAAGATGGACGAGAGGACGCTGCTGC 367
Query 233 GGGAGGCCCAGGAGCTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCCGTGAGGCAGAACGGGCTCATGTCGGGGCTGATG 306
|.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 368 GAGAGGCCAAGGAGGTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCTGTCAGGCAGAATGGGCTTATGTCTGGACTCATG 441
Query 307 CAGATGCTGCTGCTGAAGGTGTCTGCACACATCACCGAGCAGCTGGGCATGGCCCCAGGTGGCGAGTTCAGGGA 380
||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 442 CAGATGTTGCTGCTGAAGGTGTCTGCTCACATCACTGAGCAGCTGGGCATGGCCCCTGGTGGCGAGTTCAGGGA 515
Query 381 GGCCTTCAAGGAGGCCAGCAAGGTGCCTTTCTGCAAGTTCCACCTGGGTGACCGACCCATCCCCGTCACCTTCA 454
|||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 516 GGCCTTCAAAGAGGCCAGCAAGGTACCATTCTGCAAATTCCACCTGGGTGACCGACCAATCCCAGTCACCTTTA 589
Query 455 AGAGGGCCATCGCAGCGCTCTCCTTCTGGCAGAAGGTCAGGCTGGCTTGGGGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCC 528
||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 590 AGAGGGCCATTGCTGCACTCTCCTTCTGGCAGAAAGTCAAGCTGGCCTGGGGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCA 663
Query 529 ATCAGCAAGGATGACGTGGAACGCTGCAAGCAGAAGGACCTACTGGAGCAGATGATGGCCGAGATGATTGGCGA 602
||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 664 ATCAGCAAAGACGACGTGGAGCGCTGCAAACAGAAGGACCTGTTGGAGCAGATGATGGCCGAGATGATTGGGGA 737
Query 603 GTTCCCAGACCTGCACCGCACCATCGTCTCGGAGCGCGACGTCTACCTAACCTACATGCTGCGCCAGGCCGCGC 676
|||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 738 GTTTCCTGACCTGCATCGCACCATTGTCTCAGAGCGTGACGTCTATCTGACCTATATGCTGCGGCAGGCCGCAC 811
Query 677 GGCGCCTCGAGCTGCCTCGGGCCTCTGACGCCGAGCCCAGGAAGTGCGTCCCCTCCGTGGTCGTGGGCGTCGTG 750
|||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 812 GGCGCCTTGAGCTTCCCCGCGCCTCTGATGCTGAGCCCAGGAAGTGTGTCCCGTCTGTGGTTGTGGGCGTCGTT 885
Query 751 GGCATGGGCCACGTGCCTGGCATCGAGAAGAACTGGAGCACCGACCTCAACATCCAGGAGATCATGACCGTGCC 824
||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 886 GGCATGGGGCATGTGCCTGGCATTGAGAAGAACTGGAGTACCGACCTCAACATCCAGGAGATCATGACAGTCCC 959
Query 825 CCCGCCGTCCGTCTCCGGCAGAGTGTCTCGGTTGGCCGTGAAGGCCGCCTTCTTCGGCCTGCTGGGCTACAGCC 898
|||.||||||.||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 960 CCCACCGTCCATCTCAGGCAGAGTGTCCCGGGTGGCTGTGAAGGCGGCCTTCTTTGGTCTCCTGGGCTATAGCC 1033
Query 899 TGTACTGGATGGGCCGCCGCACCGCGAGCCTGGTCCTGTCGCTGCCCGCCGCGCAGTACTGCCTGCAGAGGGTG 972
||||||||||||||||.||.|||..||.||||||||||||.|||||.||.||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1034 TGTACTGGATGGGCCGTCGGACCCTGAACCTGGTCCTGTCACTGCCTGCTGCACAGTTCTGCCTCCAGAGGGTG 1107
Query 973 ACCGAGGCCCGGCACAAG---- 990
|.|||.||||||| ||.|
Sbjct 1108 AGCGAAGCCCGGC-CAGGCCGG 1128