Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12695
• Subject: XR_937151.1
• Aligned Length: 2582
• Identities: 1977
• Gaps: 605

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GAAGGCGGCGGCCTGAGGCTGCACCGGGCACGGGTCGGCCGCAATCCAGCCTGGGCGGAGCCGGAGTTGCGAGC  74

Query    1  ------------------------------ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCT  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCTGCCTAGAGGCCGAGGAGCTCACAGCTATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCT  148

Query   45  GCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGTGCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAG  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGTGCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAG  222

Query  119  TCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAACCCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGAC  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAACCCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGAC  296

Query  193  ATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGCCAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGC  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGCCAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGC  370

Query  267  CCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCCAGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC--------  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  371  CCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCCAGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGAT  444

Query  333  -------------------------------GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGAC  375
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAGAGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGAC  518

Query  376  TCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCT  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCT  592

Query  450  GCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCT  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCT  666

Query  524  GGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGC  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGC  740

Query  598  AGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTT  814

Query  672  GACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCA  888

Query  746  GGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC-----------------  802
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  889  GGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAG  962

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  963  GACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTGCAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGC  1036

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1037  GCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGGCGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCG  1110

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1111  AGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACTCGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATC  1184

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1185  GGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGT  1258

Query  803  -----------------------------------------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCT  829
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCT  1332

Query  830  TCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGG  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGG  1406

Query  904  AACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGC  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGC  1480

Query  978  TCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGG  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGG  1554

Query 1052  CTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGT  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGT  1628

Query 1126  CCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCC  1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCC  1702

Query 1200  CACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGG  1273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGG  1776

Query 1274  TGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGG  1347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGG  1850

Query 1348  GATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGA  1421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGA  1924

Query 1422  CTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACC  1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACC  1998

Query 1496  TGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGG  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGG  2072

Query 1570  AAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAA  1643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAA  2146

Query 1644  CTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCC  1717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCC  2220

Query 1718  CTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGG  1791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGG  2294

Query 1792  GCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGA  1865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGA  2368

Query 1866  CCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGG  1939
            ||||||||||||                                                              
Sbjct 2369  CCCTGCGTGCAG--------------------------------------------------------------  2380

Query 1940  GCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAG  2013
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2381  ------------------------------TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAG  2424

Query 2014  CCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2076
            |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2425  CCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTG-------  2483