Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12714
- Subject:
- NM_001288750.2
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 1237
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------ATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT 38
Query 75 GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG 112
Query 149 GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT 186
Query 223 CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG 260
Query 297 GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC 334
Query 371 TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT 408
Query 445 AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAG 482
Query 519 ATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 ATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGC 556
Query 593 CGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 CGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTG 630
Query 667 ACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 ACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG 704
Query 741 CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA 778
Query 815 ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC 852
Query 889 CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG 926
Query 963 CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT 1000
Query 1037 GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG 1074
Query 1111 GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG 1148
Query 1185 TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG 1222
Query 1259 CTCAGGACTCCCTCCTC 1275
|||||||||||||||||
Sbjct 1223 CTCAGGACTCCCTCCTC 1239