Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12758
• Subject: NM_001317238.2
• Aligned Length: 1806
• Identities: 1806
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGCTGGAAGCCCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCA  74
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Sbjct    1  ATGCAGCTGGAAGCCCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCA  74

Query   75  GACACAGGAGCGGCTGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGT  148
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Sbjct   75  GACACAGGAGCGGCTGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGT  148

Query  149  ATGAGGCCGCCGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGC  222
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Sbjct  149  ATGAGGCCGCCGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGC  222

Query  223  GAGGAGACCCGGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACT  296
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Sbjct  223  GAGGAGACCCGGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACT  296

Query  297  GAAGCAGCAGCAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGC  370
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Sbjct  297  GAAGCAGCAGCAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGC  370

Query  371  GGCGAGCCACCGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGG  444
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Sbjct  371  GGCGAGCCACCGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGG  444

Query  445  GCGCGCGCCAAGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCG  518
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Sbjct  445  GCGCGCGCCAAGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCG  518

Query  519  TCAGACCGTCTTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACC  592
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Sbjct  519  TCAGACCGTCTTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACC  592

Query  593  GGGACAAAGTGACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACA  666
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Sbjct  593  GGGACAAAGTGACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACA  666

Query  667  GCCGTCACTGGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGT  740
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Sbjct  667  GCCGTCACTGGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGT  740

Query  741  GCTGGAGGCGCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTG  814
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Sbjct  741  GCTGGAGGCGCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTG  814

Query  815  TTGTGCTTAGTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGG  888
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Sbjct  815  TTGTGCTTAGTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGG  888

Query  889  GGCCTGTACAGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCT  962
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Sbjct  889  GGCCTGTACAGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCT  962

Query  963  GCACTCAGGCATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCA  1036
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Sbjct  963  GCACTCAGGCATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCA  1036

Query 1037  TGCACAAGCTCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTC  1110
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Sbjct 1037  TGCACAAGCTCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTC  1110

Query 1111  CTTCGGAAGCGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGG  1184
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Sbjct 1111  CTTCGGAAGCGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGG  1184

Query 1185  CCAACACAGCAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCC  1258
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Sbjct 1185  CCAACACAGCAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCC  1258

Query 1259  GCATTGACGTGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGAC  1332
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Sbjct 1259  GCATTGACGTGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGAC  1332

Query 1333  AACTGTGTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTG  1406
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Sbjct 1333  AACTGTGTTCTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTG  1406

Query 1407  CTCGGAGGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCA  1480
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Sbjct 1407  CTCGGAGGTCGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCA  1480

Query 1481  CGGCATATGCCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAG  1554
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Sbjct 1481  CGGCATATGCCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAG  1554

Query 1555  TACCGACAGAAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCA  1628
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Sbjct 1555  TACCGACAGAAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCA  1628

Query 1629  AGGCGAGACCCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTA  1702
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Sbjct 1629  AGGCGAGACCCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTA  1702

Query 1703  GGATATGCTCCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGG  1776
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Sbjct 1703  GGATATGCTCCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGG  1776

Query 1777  CCGTTCTGCCCCCCAGGGCACCCCCTGTTG  1806
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Sbjct 1777  CCGTTCTGCCCCCCAGGGCACCCCCTGTTG  1806