Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12758
• Subject: XM_011542244.1
• Aligned Length: 2088
• Identities: 1806
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC  222

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGCAGCTGGAAGC  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  223  CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAATGCAGCTGGAAGC  296

Query   15  CCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCAGACACAGGAGCGGC  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCAGACACAGGAGCGGC  370

Query   89  TGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGTATGAGGCCGCCGTG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGTATGAGGCCGCCGTG  444

Query  163  GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA  518

Query  237  GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCAAC  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCAAC  592

Query  311  TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG  666

Query  385  GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC  740

Query  459  CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG  814

Query  533  AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA  888

Query  607  GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG  962

Query  681  CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC  1036

Query  755  GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC  1110

Query  829  AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA  1184

Query  903  CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG  1258

Query  977  ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT  1332

Query 1051  GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC  1406

Query 1125  CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA  1480

Query 1199  AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG  1554

Query 1273  GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA  1628

Query 1347  GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC  1702

Query 1421  GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC  1776

Query 1495  AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT  1850

Query 1569  GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA  1924

Query 1643  CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG  1998

Query 1717  ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC  2072

Query 1791  AGGGCACCCCCTGTTG  1806
            ||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGGCACCCCCTGTTG  2088