Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12789
• Subject: XM_017015197.1
• Aligned Length: 1533
• Identities: 932
• Gaps: 600

Alignment

Query    1  ATGATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  74

Query   75  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  148

Query  149  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  222

Query  223  GTCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  296
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  296

Query  297  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  370

Query  371  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  444

Query  445  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  518

Query  519  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  592

Query  593  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  666

Query  667  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGA-CCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  739
            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  740

Query  740  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  814

Query  814  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  888

Query  888  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGC----------------------------  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  889  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGA  962

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct  963  AATCTGGAGGCAGTATCACCTAACGGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGACCCGTCTCCAGTATCTCCATTCA  1036

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1037  TCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAAACAAAAAATAAAAGTACTCAAG  1110

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1111  AAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAAATGAGAACCCCCACCATGATAT  1184

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1185  AAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAAGAAACACAAAAAGAAATGAAGA  1258

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1259  ACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGTGGATGAGGATTTTCCCAGGGGC  1332

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1333  CCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGCCCTTTCACCGTTCATCACATTA  1406

Query  934  --------------------------------------------------------------------------  933
                                                                                      
Sbjct 1407  CCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAGAAGAAAAAGGAGAGGTGCTGGG  1480

Query  934  -----------------------------------------------------  933
                                                                 
Sbjct 1481  AAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTCT  1533