Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12925
Subject:
NM_001330769.1
Aligned Length:
1245
Identities:
1245
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA  74

Query   75  GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC  148

Query  149  CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  222

Query  223  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  296

Query  297  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG  370

Query  371  GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG  444

Query  445  AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA  518

Query  519  TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC  592

Query  593  GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT  666

Query  667  TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT  740

Query  741  GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA  814

Query  815  GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC  888

Query  889  AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG  962

Query  963  TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA  1036

Query 1037  CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA  1110

Query 1111  GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT  1184

Query 1185  TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA  1245
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA  1245