Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12925
- Subject:
- XM_017020177.1
- Aligned Length:
- 1855
- Identities:
- 1241
- Gaps:
- 611
Alignment
Query 1 ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA 74
Query 75 GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAA-------------- 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGGACAATGACAGGC 148
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 149 TGAAACAAGGAAGAATCACCATAGAAGAATTTAGAGCAATTTATCGAATTATCACGCACAGAGAAGAAATTATT 222
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 223 GAGATTTTCAACACATATTCTGAAAACCGGAAAATTCTTTTAGCAAGTAATCTGGCTCAATTTCTGACACAAGA 296
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 297 ACAATATGCAGCTGAGATGAGTAAAGCTATTGCTTTTGAGATCATTCAGAAATACGAGCCTATCGAAGAAGTTA 370
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 371 GGAAAGCACACCAAATGTCATTAGAAGGTTTTACAAGATACATGGATTCACGTGAATGTCTACTGTTTAAAAAT 444
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 445 GAATGTAGAAAAGTTTATCAAGATATGACTCATCCATTAAATGATTATTTTATTTCATCTTCACATAACACATA 518
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 519 TTTGGTATCTGATCAATTATTGGGACCAAGTGACCTTTGGGGATATGTAAGTGCCCTTGTGAAAGGATGCCGTT 592
Query 135 -------------------------------------------------------------------------- 134
Sbjct 593 GTTTGGAGATTGACTGCTGGGATGGAGCACAAAATGAACCTGTTGTATATCATGGCTACACACTCACAAGCAAA 666
Query 135 -----------------------------------------------GACATCTGACTACCCAGTGGTGCTCTC 161
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTCTGTTTAAAACTGTTATCCAAGCTATACACAAGTATGCATTCATGACATCTGACTACCCAGTGGTGCTCTC 740
Query 162 TTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGAGTCCT 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGAGTCCT 814
Query 236 TGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATATTAGTT 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATATTAGTT 888
Query 310 AAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGAGACAATCAAGA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGAGACAATCAAGA 962
Query 384 CAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTG 1036
Query 458 CTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATAT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATAT 1110
Query 532 CAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTT 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTT 1184
Query 606 TATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATC 1258
Query 680 CCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTG 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTG 1332
Query 754 CAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATC 1406
Query 828 ATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGT 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGT 1480
Query 902 TGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGAT 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGAT 1554
Query 976 CAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTAT 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTAT 1628
Query 1050 TATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTC 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTC 1702
Query 1124 TTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGT 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGT 1776
Query 1198 GAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA-------------------------- 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||
Sbjct 1777 GAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGACACAGCCACTCTG 1849
Query 1246 ----- 1245
Sbjct 1850 TACCA 1854
