Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12925
- Subject:
- XM_017020180.1
- Aligned Length:
- 1687
- Identities:
- 1193
- Gaps:
- 464
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTAAAGCTATTGCTTTTGAGATCATTCAGAAATACGAGCCTATCGAAGAAGTTAGGAAAGCACACCAAAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCATTAGAAGGTTTTACAAGATACATGGATTCACGTGAATGTCTACTGTTTAAAAATGAATGTAGAAAAGTTT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATCAAGATATGACTCATCCATTAAATGATTATTTTATTTCATCTTCACATAACACATATTTGGTATCTGATCAA 222
Query 1 ----------------------------ATGGAAATG-----------AGATG--GTT-TTTGTCAAAGATTCA 32
|||.||.|| .|||| ||| |||| .||||
Sbjct 223 TTATTGGGACCAAGTGACCTTTGGGGATATGTAAGTGCCCTTGTGAAAGGATGCCGTTGTTTG---GAGAT--- 290
Query 33 GGATGACTTCAGAGGTGGA----AAAATTAACC-----TAGA--------AAAAACTCAGAGG-----TTAC-- 82
|||||.|.|.|.|||| |||||.|||| ||.| |.|.|||||.|.| || |
Sbjct 291 ---TGACTGCTGGGATGGAGCACAAAATGAACCTGTTGTATATCATGGCTACACACTCACAAGCAAACTT-CTG 360
Query 83 TTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACCCAGTGGTG 156
||.||||.| |.|||.| .||.||||..||.|| |..|| ||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTTAAAACT--GTTATCC----AAGCTATACACAAGT-ATGCA----TTCATGACATCTGACTACCCAGTGGTG 423
Query 157 CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA 497
Query 231 GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT 571
Query 305 TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGT--------- 369
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGTAAGGTG 645
Query 370 -------------------------------------------------------------------------- 369
Sbjct 646 GAGGAATGGGAAGAAGAAGTGGCAGATGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA 719
Query 370 ----------------------------------------GGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAA 403
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GGATAAATTCAAAGAATCAGAAGTATTGGAATCTGTTTTAGGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAA 793
Query 404 AGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTT 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 AGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTT 867
Query 478 GTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAA 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 GTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAA 941
Query 552 TTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGT 625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 TTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGT 1015
Query 626 TCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATA 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 TCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATA 1089
Query 700 GGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGA 773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGA 1163
Query 774 TAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 TAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACA 1237
Query 848 TAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCA 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 TAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCA 1311
Query 922 TCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCG 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 TCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCG 1385
Query 996 TGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGG 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 TGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGG 1459
Query 1070 CATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCA 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 CATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCA 1533
Query 1144 CTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTC 1217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 CTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTC 1607
Query 1218 ACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA------------------------------- 1245
||||||||||||||||||.|.| .||||
Sbjct 1608 ACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGACACAGCCACTCTGTACCA 1665