Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12925
• Subject: XM_017020186.1
• Aligned Length: 1276
• Identities: 1043
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  222
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  24

Query  223  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  98

Query  297  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG  172

Query  371  GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG  246

Query  445  AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA  320

Query  519  TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC  394

Query  593  GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT  468

Query  667  TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT  542

Query  741  GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA  616

Query  815  GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC  690

Query  889  AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG  764

Query  963  TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA  838

Query 1037  CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA  912

Query 1111  GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT  986

Query 1185  TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA-------------  1245
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||             
Sbjct  987  TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGA  1059

Query 1246  ------------------  1245
                              
Sbjct 1060  CACAGCCACTCTGTACCA  1077