Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13005
Subject:
NM_001039692.1
Aligned Length:
846
Identities:
726
Gaps:
55

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
             ||.|||||..||.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --MAERSGKITAGQAYIEVEYDYEYDAKDRKIVIRQGERYLLVKKTNDDWWQVRPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  72

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
           |||||||||..||||||.|..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||.|||.||
Sbjct  73  KALMPPVKQATGLPNNSMKTIQSMHLQRSTENVNKMPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGSNYNSGQTLNL  146

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 147  SLDLTHNNGKFNSDSHSPKVSSQNRTRLFGHFPGPEFLDIEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIQQDSESGDELSSS  220

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 221  STEQMRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQVNGEWETHKDSSGRCYYYNRTTQERTWKPP  294

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQE-----------------------------------------------WLKHVDD  323
           ||.||.|.|. |||.||.||                                               |||||||
Sbjct 295  RWARDVSTSR-DFQSPGEQEPLSSEENYHSSCFSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTKEKWLKHVDD  367

Query 324  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  397
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||..|.|.||
Sbjct 368  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDSNDKDSPTTTKLCLPE  441

Query 398  NESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  471
           |||.|.|.||||..     ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  NESPPTSSKHQDPG-----QEKYGLLNVTKITENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  510

Query 472  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  545
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|.||..|||.|||
Sbjct 511  EFTVDLKGAVIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDAVINDWFKVLSSTINNQVAEADEAAEEETPDS  584

Query 546  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  619
           ||.|||||||.||..|||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585  PGVEKHDKEKDQKELKKLRSMKGSSMDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  658

Query 620  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  693
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDVDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  732

Query 694  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  767
           ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVTAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLKRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  806

Query 768  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  799
           ||.||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 807  PERETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSTVFGR  838