Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13005
Subject:
NM_001270696.2
Aligned Length:
846
Identities:
769
Gaps:
77

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQE-----------------------------------------------WLKHVDD  323
           ||||||||||||||||||||                                               |||||||
Sbjct 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370

Query 324  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  397
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTND-------------  431

Query 398  NESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  471
                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432  -----------------KDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  488

Query 472  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  545
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  562

Query 546  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  619
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  636

Query 620  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  693
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Sbjct 637  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  710

Query 694  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  767
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  784

Query 768  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  799
           ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  816