Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13005
• Subject: XM_017318001.1
• Aligned Length: 2397
• Identities: 1904
• Gaps: 270

Alignment

Query    1  ATGAAAATGGCTGACAGAAGTGGGAAGATTATTCCAGGACAAGTGTATATTGAGGTGGAATATGATTATGAATA  74
                  |||||.||.||||||||.|||||.|.|.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ------ATGGCCGAGAGAAGTGGAAAGATCACTGCAGGACAAGCGTATATTGAGGTGGAGTATGATTATGAGTA  68

Query   75  TGAAGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATAAAACAAGGGGAGAGGTACATCTTGGTGAAAAAGACCAATGATGACT  148
            |||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|.|||.||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct   69  TGACGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATCAGACAAGGGGAGCGCTACCTCCTGGTGAAGAAGACCAATGATGACT  142

Query  149  GGTGGCAAGTCAAGCCAGATGAAAACTCCAAAGCGTTTTATGTGCCAGCCCAGTATGTGAAGGAGGTCACGCGC  222
            ||||||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  143  GGTGGCAAGTCAGACCTGATGAGAACTCAAAAGCATTTTATGTGCCAGCACAGTATGTCAAGGAGGTCACTCGC  216

Query  223  AAAGCTCTCATGCCACCTGTTAAGCAGGTAGCTGGTCTGCCAAATAACTCCACGAAAATAATGCAGAGTTTGCA  296
            ||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.||.||||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||.||||
Sbjct  217  AAAGCTCTGATGCCACCTGTGAAGCAGGCAACAGGACTGCCAAATAACTCTATGAAGACAATACAGAGTATGCA  290

Query  297  TCTTCAGAGATCAACAGAAAATGTGAACAAATTGCCTGAGCTTTCAAGTTTCGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TCTCCAGAGATCGACAGAAAATGTGAACAAAATGCCTGAGCTTTCAAGTTTTGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC  364

Query  371  AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTTGGACCCAGTTATAATCAAGGTCAGACTGTCAACCTA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||..|||.||||||.||||||||
Sbjct  365  AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTCGGATCCAATTATAATTCAGGCCAGACTCTCAACCTA  438

Query  445  AGCCTGGACCTGACCCATAATAACGGAAAGTTTAACAATGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  AGCCTGGACCTGACCCATAATAATGGAAAGTTTAACAGTGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG  512

Query  519  GACACGCTCATTTGGTCATTTTCCCGGTCCAGAGTTCTTGGATGTAGAGAAAACTAGCTTCTCCCAGGAACAAT  592
            ||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  513  GACACGCTTATTTGGTCATTTTCCCGGGCCAGAGTTCTTGGACATAGAGAAAACTAGCTTCTCTCAGGAACAGT  586

Query  593  CTTGTGATTCCGCAGGAGAAGGCTCTGAAAGAATACATCAAGATTCTGAATCTGGTGATGAACTTAGCAGCAGC  666
            |.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  587  CATGTGACTCAGCTGGAGAAGGCTCCGAAAGAATACAGCAGGATTCCGAGTCTGGAGATGAACTTAGCAGCAGC  660

Query  667  TCCACTGAACAGATAAGGGCAACCACACCTCCAAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCTGTCTATGCTAACCTTCA  740
            ||||||||.|||||.||                                                         
Sbjct  661  TCCACTGAGCAGATGAG---------------------------------------------------------  677

Query  741  AGAACTGAAAATATCCCAGTCTGCTCTTCCCCCACTTCCTGGGAGCCCGGCAATTCAGATTAATGGAGAATGGG  814
                                                                                      
Sbjct  678  --------------------------------------------------------------------------  677

Query  815  AAACTCATAAAGACAGCTCAGGGCGTTGCTATTACTATAACAGAGGGACACAGGAAAGAACTTGGAAACCTCCT  888
                                                                                      
Sbjct  678  --------------------------------------------------------------------------  677

Query  889  CGTTGGACTCGGGATGCAAGCATCAGCAAAGGAGATTTCCAAAATCCAGGGGATCAAGAGTGGCTCAAGCATGT  962
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  678  -----------------------------------------------------------GTGGCTCAAGCATGT  692

Query  963  TGATGATCAAGGTAGACAATATTACTACAGTGCAGACGGATCTCGGTCAGAATGGGAATTGCCAAAGTATAATG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  TGATGATCAAGGTAGACAGTATTACTACAGCGCAGATGGATCTCGGTCAGAGTGGGAATTGCCAAAGTATAATG  766

Query 1037  CTTCATCCCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCCTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTATTA  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  767  CTTCATCTCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCTTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTGTTA  840

Query 1111  ACAAAGTGGAGACATAGCACCATTGTATTGGACACTAATGATAAGGAATCTCCAACTGCCTCAAAACCCTGCTT  1184
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|||||.|||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct  841  ACTAAATGGAGACATAGCACCATTGTGTTGGACTCCAACGACAAGGATTCTCCAACTACCACAAAACTCTGCTT  914

Query 1185  TCCTGAAAATGAGTCTTCTCCCTCCTCACCAAAGCACCAAGATACAGCCAGCAGTCCAAAGGATCAAGAGAAAT  1258
            .|||||||||||.|||.||||..|.|||.|||||||.||||||.|||||.||||||..||||.|||.|||||||
Sbjct  915  ACCTGAAAATGAATCTCCTCCTACTTCATCAAAGCATCAAGATCCAGCCGGCAGTCTGAAGGGTCAGGAGAAAT  988

Query 1259  ATGGATTATTAAATGTAACAAAAATTGCTGAAAATGGGAAAAAGGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCG  1332
            |||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  989  ATGGACTGTTAAATGTAACAAAAATTACTGAAAATGGGAAAAAAGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCA  1062

Query 1333  GTGTTGCAGGGTTCATCTTTACTTTTTACCAAAACTCAAGGAAGTAGCACAAGTTGGTTTGGCAGTAATCAGTC  1406
            |||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1063  GTGCTGCAGGGTTCGTCTTTACTTTTTACGAAAACTCAAGGAAGTAGTACAAGCTGGTTTGGGAGTAATCAGTC  1136

Query 1407  CAAACCAGAGTTCACAGTGGACCTCAAGGGGGCAACAATTGAGATGGCTTCAAAGGATAAATCCAGCAAAAAGA  1480
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||...|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1137  CAAACCAGAATTCACAGTGGACCTGAAGGGGGCAGTGATTGAAATGGCATCAAAGGACAAATCGAGCAAGAAGA  1210

Query 1481  ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGTCAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGACAATGACACTGTTATTAATGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1211  ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGACAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGATAATGATGCTGTTATTAATGAT  1284

Query 1555  TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACAATCAATAATCAGGCAGTAGAAACTGATGAAGGAATTGAAGAGGAGATACC  1628
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||.|||..|.|||||||.|..|||||||||.|.|||
Sbjct 1285  TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACTATCAATAACCAGGTAGCAGAGGCCGATGAAGCAGCTGAAGAGGAAACACC  1358

Query 1629  GGATTCACCAGGAATAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGAACAAAAGGATCCCAAAAAGCTTCGTTCCTTTAAAG  1702
            .|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.|||||.||..|.||||
Sbjct 1359  AGATTCACCAGGGGTAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGACCAGAAGGAGCTTAAAAAACTTCGCTCAATGAAAG  1432

Query 1703  TATCTAGCATAGATTCTTCAGAACAGAAAAAAACCAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACACGACGCCCCACT  1776
            .|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1433  GATCCAGCATGGATTCTTCAGAGCAGAAGAAAACTAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACCCGGCGCCCCACT  1506

Query 1777  TTGCAAGCTGTTCGTGAAAAAGGTTATATTAAAGATCAGGTATTTGGATCCAATCTCGCTAATCTGTGTCAGAG  1850
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1507  TTGCAAGCTGTTCGTGAGAAAGGTTATATCAAAGATCAAGTATTTGGATCTAATCTTGCTAATCTGTGTCAGAG  1580

Query 1851  AGAGAATGGCACAGTACCAAAGTTTGTGAAGTTATGTATTGAACATGTTGAAGAACATGGTTTGGATATTGATG  1924
            .||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1581  GGAGAATGGGACAGTGCCAAAGTTTGTGAAGTTATGCATTGAGCATGTCGAAGAGCATGGTTTAGATGTTGATG  1654

Query 1925  GGATATACAGAGTAAGTGGCAACCTCGCAGTGATCCAGAAACTAAGGTTTGCAGTCAATCATGATGAGAAATTG  1998
            |.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1655  GTATTTACAGAGTGAGTGGCAACCTTGCCGTGATCCAGAAGCTGAGGTTCGCAGTCAATCATGATGAGAAGTTG  1728

Query 1999  GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGATATTCATGTCATTACTGGAGCCCTCAAAATGTTTTTTCGAGAATTACC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1729  GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGACATTCATGTCATCACGGGAGCACTCAAAATGTTTTTTCGAGAACTACC  1802

Query 2073  AGAACCTCTTTTTACATTTAATCATTTTAATGATTTTGTTAATGCAATTAAGCAAGAACCAAGACAGCGAGTCG  2146
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1803  AGAACCTCTTTTTACGTTTAATCATTTCAATGATTTTGTTAATGCAATTAAACAAGAACCGAGACAGCGTGTCA  1876

Query 2147  CTGCTGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAACCAAGACACAATGCAGATTCTTTTCCGACATCTC  2220
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 1877  CTGCAGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAATCAAGATACAATGCAGATTCTGTTTAGACATCTC  1950

Query 2221  AGAAGAGTTATAGAAAATGGAGAGAAAAATCGAATGACCTATCAGAGTATAGCAATTGTTTTTGGTCCCACTCT  2294
            |.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1951  AAAAGGGTTATAGAAAATGGAGAAAAAAACCGAATGACCTATCAGAGCATAGCGATTGTTTTTGGCCCCACCCT  2024

Query 2295  ATTAAAACCAGAAAAAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAATCAGATTGTAGAATTAATTC  2368
            ..||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||
Sbjct 2025  TCTAAAGCCAGAAAGAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAACCAGATTGTAGAGCTGATTC  2098

Query 2369  TTCTGGAACTGAGTTCCATCTTCGGACGT  2397
            |.||||||.|.||..|..||||.||||||
Sbjct 2099  TCCTGGAATTAAGCACTGTCTTTGGACGT  2127