Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13006
Subject:
NM_001270698.2
Aligned Length:
841
Identities:
769
Gaps:
72

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
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Sbjct   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370
           ||||||||||||||||||||                                               |||||||
Sbjct 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQE-----------------------------------------------WLKHVDD  323

Query 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 324  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDK------------  385

Query 445  NESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVD  518
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386  -------------DQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVD  446

Query 519  LKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEK  592
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Sbjct 447  LKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEK  520

Query 593  HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPK  666
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Sbjct 521  HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPK  594

Query 667  FVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFN  740
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Sbjct 595  FVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFN  668

Query 741  HFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKET  814
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Sbjct 669  HFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKET  742

Query 815  GNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  841
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Sbjct 743  GNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  769