Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13019
• Subject: NM_001205369.1
• Aligned Length: 1318
• Identities: 1156
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCCGGCCGCCTGCCGTCCTTCGTGCTGGTGGTGCTACTGGTAGTCAT  74

Query   75  CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTCGTCCTTGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTTCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148

Query  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAGGTGGCCCGCGGGCGCTTGGAGAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTCTTGGTG  222

Query  223  GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA  296
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  223  GACACGCATAAGAAGCAGATCGACCAGAAGGAGGCCGATTACGGTCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAAGGA  296

Query  297  GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC  370
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCTGGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAGCTACAAAACAACATATCATATCAGATGGCAGACATAC  370

Query  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTGGCTGAGCTTCGTCAGGAGTTTCTTCGACAGGAAGATCAGCTTCAAGACTACAGG  444

Query  445  AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG  518
            ||.||.|||||.||||||||.|||.||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  445  AAAAATAATACCTACCTTGTCAAGCGGCTAGAATACGAGAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATCAAGGAGTTAAG  518

Query  519  AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|||||||||||   |||||.||.||||
Sbjct  519  AGCACAACATGAAGAAAATATTAAAAAATTAGCAGATCAGTTTTTGCAGGAACAAAAG---GAGACTCATAAGA  589

Query  593  TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG  666
            |||||||||||||||||||.|||||||.||.||||.||||.|.||.||||||||||||||||||.||..||||.
Sbjct  590  TTCAATCAAATGATGGAAAAGAATTGGGTAGAAACGATCATGGAGCACCTAAAAATATTCCAAATGTGCCTGAA  663

Query  667  AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG  740
            ||||.||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct  664  AATGATGCAAATAAGAATGAAGACCCCTCAAGCAATCATCTTCCCCATGGGAAAGAACAACTCAAACGAGTTGG  737

Query  741  TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC  814
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..|||||||||.|||||
Sbjct  738  TGATGCAGGGATGCCTGGAGTAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTAGACGAGCTTCCTGCTGCTTTAAAGAAGC  811

Query  815  CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA  888
            |.|||.|.|.||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  812  CCCCTGTGTTAGCTTCTCAACATGAAAGTCATCAGACAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAGCCTCTCTCACCA  885

Query  889  AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT  962
            ||.|||.||||||.||||||..|||||||.||||.|||.|||.||||||||||||||||.|||||.|.||||||
Sbjct  886  AACATGGCTCCAGGTTCACATCTAAACCAGAATGAAAATCCCAGTACTTCAAAACAGAACCCTTCAAATCCTCT  959

Query  963  TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA  1036
            |||||...|||||||||||.||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|...||||||||||.||||
Sbjct  960  TCAGCACATAATTCCAGGCCCAAACTTGGATCGGGAACCCAGAATTCAAACAGACACGTTAAAGCAGGCCACCA  1033

Query 1037  AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAAGCCGATTCTTTGATGAAAATGAATCCCCTGTTGATCCG  1110
            .||||||||.||.|||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  GGGACAGAGCCAATGATTTCCACAAGTTGAAGCAAAGCCGGTTCTTTGATGAGAATGAATCCCCTGTTGATCCG  1107

Query 1111  CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC  1181

Query 1185  TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGGT------GAGCGTGGGC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|      ||.||.|.||
Sbjct 1182  TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGATGATGAAGAACGAGAGC  1255

Query 1253  -----CTGG--CCTCCATGCTATAACCATGAAACCCACCTCT------AAGTTTTTTGGT  1299
                 .|||  |||.||..||||..|    |||  ||.|.||      |.||..||    
Sbjct 1256  TTCAGATGGATCCTGCAGACTATGGC----AAA--CAGCGCTTCAGTGATGTCCTT----  1305