Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13019
• Subject: NM_138423.4
• Aligned Length: 1317
• Identities: 1274
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT  74

Query   75  CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148

Query  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG  222

Query  223  GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA  296

Query  297  GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC  370

Query  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG  444

Query  445  AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG  518

Query  519  AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA  592

Query  593  TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG  666

Query  667  AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG  740

Query  741  TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC  814

Query  815  CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA  888

Query  889  AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT  962

Query  963  TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA  1036

Query 1037  AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAAGCCGATTCTTTGATGAAAATGAATCCCCTGTTGATCCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAAGCCGATTCTTTGATGAAAATGAATCCCCTGTTGATCCG  1110

Query 1111  CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC  1184

Query 1185  TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGGT------GAGCGTGGGC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|      ||.||.|.||
Sbjct 1185  TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGATGATGAAGAACGAGAGC  1258

Query 1253  -----CTGG--CCTCCATGCTATAACCATGAAACCCACCTCT-----AAGTTTTTTGGT  1299
                 .|||  |||.||..||||     .||||.|.||.|.|     |.||..||    
Sbjct 1259  TTCAAATGGATCCTGCAGACTAT-----GGAAAGCAACATTTCAATGATGTCCTT----  1308