Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13019
- Subject:
- NM_177054.5
- Aligned Length:
- 1318
- Identities:
- 1071
- Gaps:
- 131
Alignment
Query 1 ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1 ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCCGGCCGCCTGCCGTCCTTCGTGCTGGTGGTGCTACTGGTAGTCAT 74
Query 75 CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC 148
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGTCGTCCTTGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTTCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC 148
Query 149 AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG 222
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAGGTGGCCCGCGGGCGCTTGGAGAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTCTTGGTG 222
Query 223 GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA 296
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 223 GACACGCATAAGAAGCAGATCGACCAGAAGGAGGCCGATTACGGTCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAAGGA 296
Query 297 GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC 370
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGCCTGGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAGCTACAAAACAACATATCATATCAGATGGCAGACATAC 370
Query 371 ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG 444
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 371 ATCATTTAAAGGAGCAACTGGCTGAGCTTCGTCAGGAGTTTCTTCGACAGGAAGATCAGCTTCAAGACTACAGG 444
Query 445 AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG 518
||.||.|||||.||||||||.|||.||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 445 AAAAATAATACCTACCTTGTCAAGCGGCTAGAATACGAGAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATCAAGGAGTTAAG 518
Query 519 AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA 592
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..||||||||||| |||||.||.||||
Sbjct 519 AGCACAACATGAAGAAAATATTAAAAAATTAGCAGATCAGTTTTTGCAGGAACAAAAG---GAGACTCATAAGA 589
Query 593 TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG 666
|||||||||||||||||||.|||||||.||.||||.||||.|.||.||||||||||||||||||.||..||||.
Sbjct 590 TTCAATCAAATGATGGAAAAGAATTGGGTAGAAACGATCATGGAGCACCTAAAAATATTCCAAATGTGCCTGAA 663
Query 667 AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG 740
||||.||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct 664 AATGATGCAAATAAGAATGAAGACCCCTCAAGCAATCATCTTCCCCATGGGAAAGAACAACTCAAACGAGTTGG 737
Query 741 TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC 814
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||| ||||||
Sbjct 738 TGATGCAGGGATGCCTGGAGTAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTAGACGAGCTT---CCTGCT---------- 798
Query 815 CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA 888
Sbjct 799 -------------------------------------------------------------------------- 798
Query 889 AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT 962
|.||||||..|||||||.||||.|||.|||.||||||||||||||||.|||||.|.||||||
Sbjct 799 ------------GGTTCACATCTAAACCAGAATGAAAATCCCAGTACTTCAAAACAGAACCCTTCAAATCCTCT 860
Query 963 TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA 1036
|||||...|||||||||||.||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|...||||||||||.||||
Sbjct 861 TCAGCACATAATTCCAGGCCCAAACTTGGATCGGGAACCCAGAATTCAAACAGACACGTTAAAGCAGGCCACCA 934
Query 1037 AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAAGCCGATTCTTTGATGAAAATGAATCCCCTGTTGATCCG 1110
.||||||||.||.|||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 935 GGGACAGAGCCAATGATTTCCACAAGTTGAAGCAAAGCCGGTTCTTTGATGAGAATGAATCCCCTGTTGATCCG 1008
Query 1111 CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGGC 1082
Query 1185 TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGGT------GAGCGTGGGC 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||.||.|.||
Sbjct 1083 TGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATGGTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGATGATGAAGAACGAGAGC 1156
Query 1253 -----CTGG--CCTCCATGCTATAACCATGAAACCCACCTCT------AAGTTTTTTGGT 1299
.||| |||.||..||||..| ||| ||.|.|| |.||..||
Sbjct 1157 TTCAGATGGATCCTGCAGACTATGGC----AAA--CAGCGCTTCAGTGATGTCCTT---- 1206