Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13039
• Subject: NM_173030.2
• Aligned Length: 1713
• Identities: 1493
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTGGCCACTTCTCTGATGTGGGTGCTTGTTGATGTCTTCTTACT  74

Query   75  GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA  148
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct   75  CCTGTACTTCAGCGAGTGTAACAAGTGTGATGACAAGAAGGAGAGATCCCTGCTGCCTGCGCTGAGGGCTGTTA  148

Query  149  TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG  222
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TTTCAAGAAACCAAGAAGGTCCAGGAGAAATGGGAAAGGCTGTGCTTATTCCAAAAGATGACCAAGAGAAAATG  222

Query  223  AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct  223  AAAGAGTTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTCATGGCCAGTGACTTGATCGCACTTAACCGAAGTCTGCCGGA  296

Query  297  TGTAAGATTAGAAGGATGTAAGACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTC  370
            |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TGTGAGATTAGAAGGATGCAAGACTAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTCC  370

Query  371  ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTCCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct  371  ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTACTTAGAACTGTCTATAGTGTCATAAATCGCTCCCCACACTACCTGCTCTCT  444

Query  445  GAGGTCATCTTGGTAGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTT  518
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  445  GAGGTCATCTTGGTTGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAACTACGTGAAAACTTT  518

Query  519  AGAAGTGCCAGTAAAAATTATTAGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG  592
            ||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  AGAAGTGCCAGTGAAGATTATCAGGATGGAAGAGCGCTCTGGGTTAATACGCGCCCGTCTCCGAGGAGCAGCAG  592

Query  593  CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG  666
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  CTTCAAAAGGACAGGTCATAACTTTTCTGGATGCACACTGCGAGTGCACCTTAGGATGGCTGGAGCCCTTGCTG  666

Query  667  GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  GCGAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACAGTTGTGTGCCCGATCATTGATGTTATTAGTGATGATACGTTTGAGTA  740

Query  741  TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA  814
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  741  CATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGTGGTTTCAACTGGAAGCTAAATTTCCGATGGTATCCTGTCCCTCAAA  814

Query  815  GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT  888
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAAATGGATAGGAGAAAAGGAGACAGGACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT  888

Query  889  ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA  962

Query  963  AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC  1036
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  963  AATGTCTTTTAGGATCTGGCAATGTGGAGGTTCTTTGGAGATTGTGACTTGCTCTCATGTCGGTCATGTTTTTC  1036

Query 1037  GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA  1110
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GAAAGGCAACTCCATACACATTCCCTGGTGGCACTGGCCATGTCATTAACAAGAACAACAGAAGACTGGCAGAA  1110

Query 1111  GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT  1184
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGTGGATGGATGAATTCAAAGATTTCTTCTATATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT  1184

Query 1185  GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG  1258
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCAGTCAGAAAAACACTGAGGGAAAATCTGAAGTGTAAGCCTTTTTCTTGGTACCTGGAAAACATCTATCCGG  1258

Query 1259  ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1259  ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATACGAAATGTTGAGACCAATCAATGCTTAGATAAC  1332

Query 1333  ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA  1406
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1333  ATGGGCCGCAAAGAAAATGAAAAAGTGGGTATCTTCAACTGTCACGGCATGGGAGGTAACCAGGTGTTTTCTTA  1406

Query 1407  CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT  1480
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||||.|||.||||||||||||.
Sbjct 1407  TACTGCTGACAAAGAAATCCGAACTGACGACTTGTGCCTGGATGTATCCAGACTCAGTGGCCCTGTAATCATGC  1480

Query 1481  TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAG----TC---TTG------TCTCTC  1541
            |||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||    ||   |||      .||..|
Sbjct 1481  TAAAATGCCACCACATGAGAGGAAATCAGCTGTGGGAATATGACGCTGAGAGACTCACTTTGAGACATGCTAAC  1554

Query 1542  AGTGAACAAAGTAGC-TGATG--GCTCC---------CAGCAT----CCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAGC  1599
            |||.|.|||.||  | |||||  .||.|         ||..||    |||||..||.|...|||.|.||..|||
Sbjct 1555  AGTAACCAATGT--CTTGATGAACCTTCTGAAGAAGACAAAATGGTGCCTACCATGCAGGACTGCAGTGGCAGC  1626

Query 1600  ACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTATACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTTGGGA-ATTCTACTG  1672
            |..|..|||.|||||||.||.||.|||         |||               |..||.|||| |        
Sbjct 1627  AGATCCCAACAATGGCTGCTGAGGAAC---------ATG---------------ACCTTGGGGACA--------  1668

Query 1673  ATTACATTCTC  1683
                       
Sbjct 1669  -----------  1668