Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13039
- Subject:
- XM_006498092.2
- Aligned Length:
- 1713
- Identities:
- 1493
- Gaps:
- 75
Alignment
Query 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTGGCCACTTCTCTGATGTGGGTGCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
Query 75 GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA 148
.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 CCTGTACTTCAGCGAGTGTAACAAGTGTGATGACAAGAAGGAGAGATCCCTGCTGCCTGCGCTGAGGGCTGTTA 148
Query 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG 222
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGTCCAGGAGAAATGGGAAAGGCTGTGCTTATTCCAAAAGATGACCAAGAGAAAATG 222
Query 223 AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA 296
||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 223 AAAGAGTTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTCATGGCCAGTGACTTGATCGCACTTAACCGAAGTCTGCCGGA 296
Query 297 TGTAAGATTAGAAGGATGTAAGACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTC 370
|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 TGTGAGATTAGAAGGATGCAAGACTAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTCC 370
Query 371 ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTCCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCA 444
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 371 ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTACTTAGAACTGTCTATAGTGTCATAAATCGCTCCCCACACTACCTGCTCTCT 444
Query 445 GAGGTCATCTTGGTAGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTT 518
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 445 GAGGTCATCTTGGTTGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAACTACGTGAAAACTTT 518
Query 519 AGAAGTGCCAGTAAAAATTATTAGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG 592
||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 519 AGAAGTGCCAGTGAAGATTATCAGGATGGAAGAGCGCTCTGGGTTAATACGCGCCCGTCTCCGAGGAGCAGCAG 592
Query 593 CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG 666
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 CTTCAAAAGGACAGGTCATAACTTTTCTGGATGCACACTGCGAGTGCACCTTAGGATGGCTGGAGCCCTTGCTG 666
Query 667 GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 667 GCGAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACAGTTGTGTGCCCGATCATTGATGTTATTAGTGATGATACGTTTGAGTA 740
Query 741 TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA 814
.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 741 CATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGTGGTTTCAACTGGAAGCTAAATTTCCGATGGTATCCTGTCCCTCAAA 814
Query 815 GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT 888
||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGAAATGGATAGGAGAAAAGGAGACAGGACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT 888
Query 889 ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA 962
Query 963 AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC 1036
|||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 963 AATGTCTTTTAGGATCTGGCAATGTGGAGGTTCTTTGGAGATTGTGACTTGCTCTCATGTCGGTCATGTTTTTC 1036
Query 1037 GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA 1110
|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 GAAAGGCAACTCCATACACATTCCCTGGTGGCACTGGCCATGTCATTAACAAGAACAACAGAAGACTGGCAGAA 1110
Query 1111 GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT 1184
||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGTGGATGGATGAATTCAAAGATTTCTTCTATATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT 1184
Query 1185 GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG 1258
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCAGTCAGAAAAACACTGAGGGAAAATCTGAAGTGTAAGCCTTTTTCTTGGTACCTGGAAAACATCTATCCGG 1258
Query 1259 ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1259 ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATACGAAATGTTGAGACCAATCAATGCTTAGATAAC 1332
Query 1333 ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA 1406
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 ATGGGCCGCAAAGAAAATGAAAAAGTGGGTATCTTCAACTGTCACGGCATGGGAGGTAACCAGGTGTTTTCTTA 1406
Query 1407 CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT 1480
.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||||.|||.||||||||||||.
Sbjct 1407 TACTGCTGACAAAGAAATCCGAACTGACGACTTGTGCCTGGATGTATCCAGACTCAGTGGCCCTGTAATCATGC 1480
Query 1481 TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAG----TC---TTG------TCTCTC 1541
|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||| || ||| .||..|
Sbjct 1481 TAAAATGCCACCACATGAGAGGAAATCAGCTGTGGGAATATGACGCTGAGAGACTCACTTTGAGACATGCTAAC 1554
Query 1542 AGTGAACAAAGTAGC-TGATG--GCTCC---------CAGCAT----CCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAGC 1599
|||.|.|||.|| | ||||| .||.| ||..|| |||||..||.|...|||.|.||..|||
Sbjct 1555 AGTAACCAATGT--CTTGATGAACCTTCTGAAGAAGACAAAATGGTGCCTACCATGCAGGACTGCAGTGGCAGC 1626
Query 1600 ACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTATACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTTGGGA-ATTCTACTG 1672
|..|..|||.|||||||.||.||.||| ||| |..||.|||| |
Sbjct 1627 AGATCCCAACAATGGCTGCTGAGGAAC---------ATG---------------ACCTTGGGGACA-------- 1668
Query 1673 ATTACATTCTC 1683
Sbjct 1669 ----------- 1668